87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1832 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  100 
 
 		 197 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  80.73 
 
 		 198 aa  321  5e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  77.66 
 
 		 197 aa  303  9.000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  74.49 
 
 		 197 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  74.49 
 
 		 197 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  74.49 
 
 		 202 aa  300  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1890  DoxX family protein  85.19 
 
 		 195 aa  289  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  70.41 
 
 		 197 aa  289  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  74.86 
 
 		 198 aa  286  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2479  DoxX family protein  70.92 
 
 		 197 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1807  DoxX family protein  70.41 
 
 		 197 aa  280  9e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1846  DoxX family protein  69.39 
 
 		 197 aa  277  9e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1739  DoxX family protein  76.19 
 
 		 196 aa  275  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2710  hypothetical protein  73.06 
 
 		 197 aa  263  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2316  DoxX  73.82 
 
 		 196 aa  249  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  58.33 
 
 		 216 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  57.95 
 
 		 204 aa  224  7e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  58.06 
 
 		 196 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  57.53 
 
 		 196 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1556  DoxX family protein  61.96 
 
 		 199 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2586  DoxD-like family protein  46.3 
 
 		 232 aa  194  9e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  34.04 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  31.25 
 
 		 147 aa  64.3  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  31.75 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  31.75 
 
 		 144 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  40.43 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  33.64 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  30.94 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  34.91 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  29.17 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  33.71 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  34.55 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  34.78 
 
 		 134 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  42.34 
 
 		 149 aa  54.3  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  33.59 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  30.69 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  32.4 
 
 		 150 aa  53.1  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  44.09 
 
 		 147 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  34.34 
 
 		 183 aa  52  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  39.62 
 
 		 148 aa  52  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  34.34 
 
 		 183 aa  52  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  43.48 
 
 		 147 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  43.48 
 
 		 147 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  51.6  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  43.48 
 
 		 147 aa  51.2  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  35.11 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  35.11 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  39.56 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  34.34 
 
 		 135 aa  49.3  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  41.58 
 
 		 147 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  31.87 
 
 		 133 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  30.77 
 
 		 133 aa  49.3  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  30.77 
 
 		 133 aa  49.3  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  41.58 
 
 		 147 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  41.58 
 
 		 147 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  28.49 
 
 		 146 aa  48.9  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  41.58 
 
 		 147 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  36.36 
 
 		 144 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  38.89 
 
 		 143 aa  48.1  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  48.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  37.04 
 
 		 137 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  29.89 
 
 		 145 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  34.02 
 
 		 148 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  30 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  34.83 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  30.73 
 
 		 150 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  41.25 
 
 		 131 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  31.4 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  35.96 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  30.46 
 
 		 149 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  31.76 
 
 		 127 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  43.48 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  29.35 
 
 		 145 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  33.71 
 
 		 144 aa  44.7  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  32.14 
 
 		 137 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  29.35 
 
 		 145 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  42.27 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  39.66 
 
 		 145 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  39.53 
 
 		 131 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  34.18 
 
 		 164 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  27.59 
 
 		 154 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  36.59 
 
 		 139 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  36.84 
 
 		 153 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  35.79 
 
 		 141 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  32.94 
 
 		 123 aa  42.4  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  37.23 
 
 		 161 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  32.65 
 
 		 173 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>