60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1556 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1556  DoxX family protein  100 
 
 		 199 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  77.04 
 
 		 196 aa  308  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  76.53 
 
 		 196 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  61.22 
 
 		 197 aa  237  8e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  59.49 
 
 		 197 aa  236  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  66.67 
 
 		 198 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  60.2 
 
 		 197 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  60.71 
 
 		 202 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  61.26 
 
 		 197 aa  231  6e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  59.59 
 
 		 198 aa  225  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2479  DoxX family protein  62.3 
 
 		 197 aa  222  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1807  DoxX family protein  61.78 
 
 		 197 aa  221  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1846  DoxX family protein  61.78 
 
 		 197 aa  221  6e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  58.03 
 
 		 197 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  53.73 
 
 		 216 aa  210  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1739  DoxX family protein  59.24 
 
 		 196 aa  207  8e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2710  hypothetical protein  59.79 
 
 		 197 aa  206  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1890  DoxX family protein  60.53 
 
 		 195 aa  202  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2316  DoxX  56.41 
 
 		 196 aa  192  4e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  50.49 
 
 		 204 aa  188  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2586  DoxD-like family protein  42.86 
 
 		 232 aa  165  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  29.17 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  31.67 
 
 		 144 aa  67.4  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1303  DoxX family protein  31.71 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279966 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  39.05 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  31.84 
 
 		 164 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  39.51 
 
 		 188 aa  51.2  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  29.23 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  36.67 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  36.67 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  38.89 
 
 		 141 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  35.56 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  32.37 
 
 		 148 aa  48.5  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  39.51 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  30.32 
 
 		 149 aa  48.5  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  36.67 
 
 		 185 aa  48.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  30.85 
 
 		 148 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  30.64 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  29.82 
 
 		 144 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3375  DoxX  28.8 
 
 		 171 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.239229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  38.3 
 
 		 139 aa  46.2  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  39.29 
 
 		 172 aa  45.4  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  29.9 
 
 		 144 aa  45.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  30.17 
 
 		 149 aa  45.1  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  37.04 
 
 		 145 aa  45.1  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  35.56 
 
 		 127 aa  45.1  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1436  DoxX family protein  33.71 
 
 		 164 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  31.03 
 
 		 133 aa  44.3  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  40.66 
 
 		 143 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  31.13 
 
 		 154 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  31.03 
 
 		 133 aa  44.3  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  28.65 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  35.11 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  25.88 
 
 		 148 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3563  DoxX family protein  28.57 
 
 		 130 aa  42.4  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1654  normal  0.902228 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  32.14 
 
 		 154 aa  42.4  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  32.14 
 
 		 154 aa  42.4  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3128  DoxX family protein  31.3 
 
 		 166 aa  42.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  30.43 
 
 		 136 aa  42.4  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  34.34 
 
 		 146 aa  41.6  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>