48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3375 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3375  DoxX  100 
 
 		 171 aa  343  7e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.239229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1303  DoxX family protein  65.77 
 
 		 173 aa  195  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0991  hypothetical protein  75.68 
 
 		 169 aa  191  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2400  DoxX family protein  66 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3295  DoxX family protein  67.81 
 
 		 162 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1906  DoxX family protein  69.18 
 
 		 162 aa  160  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.646959  normal  0.313164 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2006  DoxX family protein  66.01 
 
 		 160 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2637  DoxX family protein  45.64 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.920826  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  44.9 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  31.29 
 
 		 147 aa  62  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  30.81 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  29.19 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  31.76 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  35.78 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  31.19 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  35.78 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0320  DoxX family protein  28.47 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  29.77 
 
 		 216 aa  52  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  29.17 
 
 		 154 aa  51.2  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  31.18 
 
 		 123 aa  50.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  28.44 
 
 		 197 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  28.89 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  25.54 
 
 		 198 aa  48.9  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  30.87 
 
 		 148 aa  48.5  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  34.02 
 
 		 143 aa  48.5  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  31.21 
 
 		 149 aa  47.8  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  34.71 
 
 		 128 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  28.57 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  27.34 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  26.96 
 
 		 198 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  30.91 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1556  DoxX family protein  27.71 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  30.7 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2479  DoxX family protein  30.28 
 
 		 197 aa  44.3  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1002  hypothetical protein  26.62 
 
 		 154 aa  44.3  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  38.64 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4649  DoxX  28.48 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  30 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1846  DoxX family protein  29.36 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  34.29 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4101  DoxX family protein  31.25 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1807  DoxX family protein  29.36 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2710  hypothetical protein  34.65 
 
 		 197 aa  42.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1436  DoxX family protein  28.76 
 
 		 164 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  38.64 
 
 		 148 aa  41.6  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  25.95 
 
 		 204 aa  41.2  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  27.52 
 
 		 148 aa  41.6  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2316  DoxX  30.19 
 
 		 196 aa  41.2  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>