71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01610 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  243  6.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  51.69 
 
 		 136 aa  120  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  48.7 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  45.45 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  41.03 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  42.73 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  33.05 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  33.05 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  33.05 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0240  hypothetical protein  36.97 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1964  DoxX  33.33 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0824  DoxX family protein  35.83 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0639123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5722  DoxX family protein  32.48 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.486124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4101  DoxX family protein  42.31 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  30.47 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5453  DoxX family protein  33.63 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.403659  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  32.8 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  31.67 
 
 		 148 aa  52  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  31.93 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  30.23 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0320  DoxX family protein  29.27 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  37.65 
 
 		 198 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  32.31 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  34.04 
 
 		 197 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  27.64 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  38.04 
 
 		 204 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  34.17 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  30.51 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  26.98 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  29.27 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  35.29 
 
 		 198 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  25.6 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  31.52 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  32.98 
 
 		 197 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2914  DoxX family protein  29.79 
 
 		 185 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  34.41 
 
 		 197 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  25.98 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  34.45 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0267  hypothetical protein  37.5 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  34.41 
 
 		 202 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  31.71 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  34.18 
 
 		 197 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  31.69 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  27.56 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  32.17 
 
 		 137 aa  42.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02871  hypothetical protein  36.08 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.714602  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  32.5 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  25.6 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2974  DoxX  33.87 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00548742  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  33.08 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  32.94 
 
 		 197 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1172  DoxX family protein  33.33 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3375  DoxX  31.18 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.239229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  30.89 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  48.78 
 
 		 216 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  28.57 
 
 		 130 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2995  DoxX family protein  39.29 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00203576  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02881  hypothetical protein  35.05 
 
 		 186 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  26.77 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1739  DoxX family protein  48.78 
 
 		 196 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  28.89 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  30 
 
 		 182 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1631  hypothetical protein  34.44 
 
 		 177 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03431  hypothetical protein  34.44 
 
 		 177 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02981  hypothetical protein  30.5 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.925648  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  29.2 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  39.44 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  33.08 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  30 
 
 		 172 aa  40.4  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  30.83 
 
 		 183 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  32.33 
 
 		 145 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>