169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3092 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  295  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  47.52 
 
 
144 aa  138  3e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  31.94 
 
 
197 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  32.98 
 
 
197 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  32.09 
 
 
202 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  31.94 
 
 
197 aa  83.6  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  40 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1846  DoxX family protein  31.94 
 
 
197 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  32.76 
 
 
196 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1807  DoxX family protein  31.94 
 
 
197 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  31.87 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2479  DoxX family protein  31.41 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2637  DoxX family protein  36.76 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.920826  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  31.69 
 
 
216 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2710  hypothetical protein  41.9 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  28.49 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1556  DoxX family protein  30.43 
 
 
199 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  28.98 
 
 
198 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  42.16 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  27.57 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  36.36 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  38.04 
 
 
204 aa  64.7  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  39.6 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  33.83 
 
 
198 aa  63.9  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  37.59 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  38.61 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  39.53 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  39.22 
 
 
148 aa  61.6  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  37.62 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  37.25 
 
 
151 aa  60.8  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  35.77 
 
 
146 aa  60.5  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1739  DoxX family protein  27.92 
 
 
196 aa  60.5  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  32.33 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  38.24 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  33.64 
 
 
197 aa  58.2  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  34.35 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1890  DoxX family protein  36.7 
 
 
195 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  32 
 
 
146 aa  57.8  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  32.59 
 
 
141 aa  57  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4427  DoxX family protein  40.86 
 
 
131 aa  57  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  40.2 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4059  DoxX family protein  40.86 
 
 
131 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528978  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4541  DoxX family protein  40.86 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0910404  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1303  DoxX family protein  30.37 
 
 
173 aa  55.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.279966 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  29.2 
 
 
164 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2586  DoxD-like family protein  32.26 
 
 
232 aa  55.1  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2316  DoxX  37.23 
 
 
196 aa  54.3  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  32.61 
 
 
154 aa  53.9  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  33.07 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  36.27 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  34.31 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  36.46 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3262  DoxX family protein  38.02 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83259  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  34.65 
 
 
145 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  33.66 
 
 
145 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3375  DoxX  31.29 
 
 
171 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.239229  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  36.84 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  32.58 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  33.58 
 
 
136 aa  51.2  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  30.56 
 
 
149 aa  50.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  26.06 
 
 
153 aa  50.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  38.24 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  38.24 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  35.92 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  32.67 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  37.5 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  38.24 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  35.29 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  33.66 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  31.78 
 
 
154 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  31.78 
 
 
154 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0733  DoxX family protein  33.59 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.943309  normal  0.707851 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  38.24 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  38.24 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0591  DoxX family protein  35.92 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  33.85 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  27.56 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  36.46 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2048  DoxX family protein  29.23 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000018933  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3842  DoxX family protein  36.78 
 
 
128 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000608334  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  33.59 
 
 
171 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0320  DoxX family protein  27.74 
 
 
144 aa  47  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  30.2 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  34.31 
 
 
147 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  34.31 
 
 
147 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  34.31 
 
 
147 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  30.71 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1057  DoxX family protein  34 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00355  NADH dehydrogenase  28.48 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4065  DoxX  28.68 
 
 
181 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4140  DoxX family protein  28.68 
 
 
181 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.977135  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4294  DoxX family protein  28.68 
 
 
181 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322086  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  32.26 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3079  DoxX family protein  38.33 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.738781  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  33.96 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5119  DoxX family protein  36.05 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000103447  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  32 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4208  DoxX family protein  36.09 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.550603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4442  hypothetical protein  36.09 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4106  hypothetical protein  36.09 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>