56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1906 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1906  DoxX family protein  100 
 
 		 162 aa  319  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.646959  normal  0.313164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3295  DoxX family protein  89.4 
 
 		 162 aa  207  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2006  DoxX family protein  87.18 
 
 		 160 aa  207  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2400  DoxX family protein  88.08 
 
 		 162 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3375  DoxX  68.21 
 
 		 171 aa  194  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.239229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0991  hypothetical protein  76.35 
 
 		 169 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1303  DoxX family protein  58.6 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279966 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  52.48 
 
 		 152 aa  137  7e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2637  DoxX family protein  37.82 
 
 		 153 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.920826  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  35.92 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  34.31 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  33.1 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0320  DoxX family protein  31.87 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  31.69 
 
 		 196 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  29.95 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  29.44 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  31.67 
 
 		 196 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  30 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1556  DoxX family protein  30.54 
 
 		 199 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  32.87 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  27.96 
 
 		 197 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  27.96 
 
 		 197 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  35.34 
 
 		 143 aa  51.2  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  34.58 
 
 		 202 aa  50.8  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  31.06 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3395  DoxD family protein  38.55 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  32.2 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  31.9 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4649  DoxX  32.41 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  34.93 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  36.21 
 
 		 216 aa  48.5  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00355  NADH dehydrogenase  31.69 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  31.62 
 
 		 148 aa  48.5  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  30.67 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1739  DoxX family protein  28.76 
 
 		 196 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  37.17 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002082  membrane protein  28.87 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  31.97 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  29.36 
 
 		 123 aa  45.4  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  28.96 
 
 		 204 aa  45.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  37.17 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  38.55 
 
 		 139 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  30.43 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  30.77 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  27.17 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5936  DoxX family protein  27.22 
 
 		 172 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2690  DoxX  30.26 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.360255  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  26.62 
 
 		 137 aa  42.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1890  DoxX family protein  40 
 
 		 195 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  32.98 
 
 		 149 aa  42  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  37.35 
 
 		 139 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  37.35 
 
 		 139 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2361  DoxX family protein  38.75 
 
 		 160 aa  41.2  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5722  DoxX family protein  38.18 
 
 		 137 aa  40.8  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.486124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2316  DoxX  37 
 
 		 196 aa  40.4  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  31.91 
 
 		 148 aa  40.4  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>