37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4649 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4649  DoxX  100 
 
 		 174 aa  345  3e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0584  hypothetical protein  63.58 
 
 		 165 aa  192  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399737  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1432  DoxX family protein  65.49 
 
 		 175 aa  189  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  64.52 
 
 		 141 aa  168  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  50 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  54.62 
 
 		 167 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5936  DoxX family protein  53.85 
 
 		 172 aa  137  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6307  DoxX family protein  46.4 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188963  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0755  DoxX family protein  42.4 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  43.55 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4682  thiosulphate:quinone oxidoreductase (TQO) small subunit(DoxD domain)  42.5 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  37.57 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  38.24 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2030  DoxX family protein  45.19 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  36.3 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3128  DoxX family protein  32.32 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  40.48 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2188  DoxX family protein  44.8 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62019  normal  0.793728 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3068  DoxX family protein  45 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00512546  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0990  DoxX family protein  42.52 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1027  DoxX family protein  41.73 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  35.38 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  32.84 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  32.84 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  51.6  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002082  membrane protein  32.31 
 
 		 151 aa  51.2  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00355  NADH dehydrogenase  33.08 
 
 		 151 aa  51.2  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2361  DoxX family protein  33.85 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3395  DoxD family protein  30.37 
 
 		 156 aa  48.5  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  32.41 
 
 		 146 aa  47.8  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2690  DoxX  32.43 
 
 		 152 aa  47.8  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.360255  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1002  hypothetical protein  28 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0941  DoxX family protein  33.6 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  27.27 
 
 		 144 aa  45.1  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  31.52 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  28.39 
 
 		 144 aa  42  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  34.44 
 
 		 183 aa  42  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>