179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0022 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  288  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  59.31 
 
 		 154 aa  170  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  57.93 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  48.63 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1775  DoxX family protein  44.52 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.019545 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  46.76 
 
 		 148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  52.78 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  52.41 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  49.65 
 
 		 145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  45.74 
 
 		 154 aa  110  8.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  52.05 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  47.45 
 
 		 145 aa  104  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  40.82 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0883  DoxX family protein  41.73 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  35.37 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  37.67 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  35.17 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  38.78 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  38.62 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  39.31 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  37.41 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  36.99 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  35.62 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  36.3 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  39.04 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  38.89 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  39.04 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  39.04 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2411  DoxX-like  43.38 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  35.37 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  37.41 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2062  DoxD-like family protein  39.46 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  38.78 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  37.67 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  40.82 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  35.62 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  34.75 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  37.04 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  37.41 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  36.69 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  34.25 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  40.14 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  35.51 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  37.41 
 
 		 174 aa  62  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2257  DoxD-like family protein  40.14 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.418604  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  39.31 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1057  DoxX family protein  37.04 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  36.55 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  32.35 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  31.51 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  38.85 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2277  DoxX family protein  42.76 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  normal  0.928998 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  39.39 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  32 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  31.51 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  31.51 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4427  DoxX family protein  50 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  34.78 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  36.09 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  32.19 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  38.3 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0502  DoxX family membrane protein  34.01 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  42.31 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  36 
 
 		 239 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  36.69 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  36.69 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4059  DoxX family protein  48.48 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  36.69 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  38.46 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6128  hypothetical protein  47.62 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.134606 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  33.83 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  32.65 
 
 		 175 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  32.59 
 
 		 136 aa  52  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  31.91 
 
 		 378 aa  51.6  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  37.23 
 
 		 164 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4541  DoxX family protein  46.97 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0910404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  33.33 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  28.1 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  32.41 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  29.41 
 
 		 180 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  38.24 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1493  DoxX  37.5 
 
 		 177 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  28.33 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1515  DoxX family protein  37.5 
 
 		 177 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1491  DoxX family protein  37.5 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  30.28 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3262  DoxX family protein  38.64 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83259  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  32.41 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  32.41 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13020  hypothetical protein  31.88 
 
 		 279 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.923899  normal  0.136283 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  31.72 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2401  hypothetical protein  37.29 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  28.47 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  37.38 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  33.64 
 
 		 170 aa  47.8  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  31.91 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  34.55 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  33.98 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4649  DoxX  32.41 
 
 		 174 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  27.47 
 
 		 198 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>