149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4310 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  100 
 
 		 147 aa  284  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6128  hypothetical protein  58.91 
 
 		 144 aa  127  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.134606 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0431  DoxX family protein  51.82 
 
 		 136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  48.85 
 
 		 133 aa  120  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  52.38 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  51.18 
 
 		 137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4427  DoxX family protein  54.76 
 
 		 131 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4541  DoxX family protein  53.97 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0910404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4059  DoxX family protein  53.97 
 
 		 131 aa  104  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4512  DoxX family protein  52.71 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.794637 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2450  DoxX family protein  50 
 
 		 137 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0306678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1834  DoxX  50 
 
 		 137 aa  96.7  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2445  DoxX family protein  50 
 
 		 137 aa  96.7  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  47.79 
 
 		 170 aa  96.7  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5776  DoxX family membrane protein  50.39 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  48.08 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2360  DoxX family protein  48.84 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462375  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2492  DoxX family protein  48.84 
 
 		 137 aa  93.6  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.212338  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5142  DoxX family protein  54.33 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1372  DoxX family protein  42.31 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1006  DoxX family protein  48.45 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4177  DoxX  45.31 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0698  DoxD-like family protein  46.22 
 
 		 138 aa  83.6  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.303263  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1201  hypothetical protein  46.22 
 
 		 138 aa  83.6  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2315  DoxD-like family protein  46.22 
 
 		 138 aa  83.6  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0132725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2972  DoxD-like family protein  46.22 
 
 		 138 aa  83.6  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390379  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1040  DoxX family membrane protein  46.22 
 
 		 138 aa  83.6  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1046  DoxX family protein  46.22 
 
 		 138 aa  83.6  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1627  DoxD-like family protein  46.22 
 
 		 138 aa  83.6  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00417873  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03045  DoxX subfamily  47.92 
 
 		 87 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  40.16 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  37.41 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  36.09 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0614  DoxD-like family  40.24 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  32.31 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  34.43 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1539  DoxD family protein  39.02 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.636212  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  33.06 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  32.28 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  31.01 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  38.61 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  34.53 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  34.71 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  35.71 
 
 		 175 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  31.97 
 
 		 143 aa  52  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  33.33 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  32.64 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  37.88 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  28.8 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0684  DoxX  32.5 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000773987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4065  DoxX  35.71 
 
 		 181 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  36.23 
 
 		 144 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4140  DoxX family protein  35.71 
 
 		 181 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.977135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4294  DoxX family protein  35.71 
 
 		 181 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  32.81 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  31.06 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  36.97 
 
 		 140 aa  50.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  36.51 
 
 		 171 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  36.03 
 
 		 157 aa  50.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  32.09 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0701  DoxX family protein  38.13 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  37.35 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  36.51 
 
 		 174 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  35.2 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  42.25 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  30 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  45.57 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  38.95 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3589  putative inner membrane protein YqjF  31.51 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.24023 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0502  DoxX family membrane protein  39.39 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  31.54 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  42.57 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  32.85 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  31.34 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  32.03 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  31.01 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0758  DoxX  46.77 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974867  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  30.82 
 
 		 161 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  30.82 
 
 		 161 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1239  DoxX family protein  46.77 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2401  hypothetical protein  37.93 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  30.82 
 
 		 161 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  27.07 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  34.81 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  34.07 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  33.81 
 
 		 239 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  31.85 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1096  DoxX family protein  31.13 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000704586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1118  DoxX family protein  31.13 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000073687  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  29.27 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  30.83 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1212  DoxX family protein  45.16 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  32.04 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  28.91 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  36.29 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  30 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  44.3 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  25.6 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  29.37 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  31.54 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>