82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1765 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1765  DoxX  100 
 
 
127 aa  243  6.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  49.59 
 
 
149 aa  114  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  47.62 
 
 
138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  47.54 
 
 
140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  47.58 
 
 
144 aa  110  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  44.35 
 
 
144 aa  107  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  43.31 
 
 
131 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  44 
 
 
136 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  41.27 
 
 
130 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  42.74 
 
 
140 aa  104  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  43.2 
 
 
144 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1661  DoxX  45.97 
 
 
132 aa  101  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  41.94 
 
 
143 aa  100  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  42.4 
 
 
138 aa  100  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  41.94 
 
 
143 aa  100  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  40.32 
 
 
144 aa  99.4  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  39.84 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  41.41 
 
 
134 aa  98.6  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  41.46 
 
 
128 aa  99  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  43.55 
 
 
143 aa  99  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  43.55 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  35.2 
 
 
130 aa  93.6  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  42.4 
 
 
150 aa  91.3  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  37.3 
 
 
127 aa  90.9  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  43.65 
 
 
128 aa  90.5  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  38.94 
 
 
131 aa  88.2  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0915  DoxX  42.45 
 
 
131 aa  87.8  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  37.8 
 
 
134 aa  87.4  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2974  DoxX  37.3 
 
 
134 aa  87.4  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00548742  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  39.25 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  39.62 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2122  DoxX family protein  36.28 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0176  SRC kinase associated phosphoprotein 2  40.87 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.479419  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3963  DoxX family protein  33.64 
 
 
114 aa  67.4  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804647  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  38.58 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  34.17 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  29.13 
 
 
136 aa  51.2  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  28.8 
 
 
147 aa  51.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4492  hypothetical protein  37.61 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  30.08 
 
 
133 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4208  DoxX family protein  34.92 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.550603  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0756  hypothetical protein  36.75 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4480  hypothetical protein  36.75 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4441  hypothetical protein  36.75 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0431  DoxX family protein  31.67 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4589  hypothetical protein  36.75 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4106  hypothetical protein  36.75 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4442  hypothetical protein  36.75 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4095  hypothetical protein  36.75 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4257  hypothetical protein  36.75 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3079  DoxX family protein  33.33 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.738781  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  32.56 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  30.16 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4177  DoxX  30.77 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0921  hypothetical protein  35.77 
 
 
134 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77995e-43 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0990  hypothetical protein  35.25 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0667403  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0722  hypothetical protein  35.25 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000540501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0825  hypothetical protein  35.25 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116306  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0347  DoxX  29.23 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000430544  normal  0.0908673 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0735  hypothetical protein  35.77 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.7492600000000004e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4456  hypothetical protein  35.25 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0296685  normal  0.654993 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0786  hypothetical protein  35.25 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000245891  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0879  hypothetical protein  35.25 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  30.16 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0735  DoxX family protein  35.25 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0648582  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  30.16 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02981  hypothetical protein  26.62 
 
 
186 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.925648  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  28.35 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  29.27 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  27.27 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3233  DoxX family protein  31.3 
 
 
405 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  28 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02871  hypothetical protein  25.9 
 
 
186 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.714602  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02881  hypothetical protein  25.18 
 
 
186 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  29.51 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  31.06 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  30.16 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5453  DoxX family protein  29.07 
 
 
136 aa  40.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.403659  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0267  hypothetical protein  23.74 
 
 
186 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4140  DoxX family protein  29.37 
 
 
181 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.977135  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  35.29 
 
 
144 aa  40  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4065  DoxX  29.37 
 
 
181 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>