124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5142 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5142  DoxX family protein  100 
 
 		 132 aa  245  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4427  DoxX family protein  89.23 
 
 		 131 aa  191  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4059  DoxX family protein  89.23 
 
 		 131 aa  191  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4541  DoxX family protein  88.46 
 
 		 131 aa  189  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0910404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4512  DoxX family protein  85.61 
 
 		 132 aa  179  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.794637 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6128  hypothetical protein  75.78 
 
 		 144 aa  164  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.134606 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0431  DoxX family protein  62.4 
 
 		 136 aa  137  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  54.55 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  54.33 
 
 		 147 aa  124  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  50 
 
 		 144 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  51.56 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  57.14 
 
 		 152 aa  105  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1372  DoxX family protein  50.76 
 
 		 152 aa  105  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  50.45 
 
 		 170 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4177  DoxX  54.76 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1834  DoxX  51.15 
 
 		 137 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2445  DoxX family protein  51.15 
 
 		 137 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2360  DoxX family protein  51.56 
 
 		 137 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462375  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2492  DoxX family protein  51.56 
 
 		 137 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.212338  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5776  DoxX family membrane protein  51.15 
 
 		 137 aa  94  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2450  DoxX family protein  50.38 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0306678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1006  DoxX family protein  51.26 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0698  DoxD-like family protein  49.59 
 
 		 138 aa  88.2  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.303263  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1201  hypothetical protein  49.59 
 
 		 138 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2315  DoxD-like family protein  49.59 
 
 		 138 aa  88.2  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0132725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2972  DoxD-like family protein  49.59 
 
 		 138 aa  88.2  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390379  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1040  DoxX family membrane protein  49.59 
 
 		 138 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1046  DoxX family protein  49.59 
 
 		 138 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1627  DoxD-like family protein  49.59 
 
 		 138 aa  88.2  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00417873  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03045  DoxX subfamily  52.13 
 
 		 87 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  46.39 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  45.37 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  40.91 
 
 		 143 aa  60.1  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  35.82 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  35.82 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  38.33 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  40 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  38.83 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  39.45 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  39.45 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  40.74 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  36.7 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1096  DoxX family protein  36.08 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000704586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1118  DoxX family protein  36.08 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000073687  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  40.16 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  34.65 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0591  DoxX family protein  42.42 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  39.45 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  37.4 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  38.74 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  36.36 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3262  DoxX family protein  44.44 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83259  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  34.09 
 
 		 134 aa  50.4  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  36.43 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  39.18 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  34.07 
 
 		 175 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  35.88 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  33.58 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  37.04 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  37.27 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  48.1 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  38.1 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  37.96 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  37.96 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  37.82 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  36.63 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2401  hypothetical protein  35.48 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  42.16 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  37.96 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  32.48 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  37.29 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  36.13 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  41.18 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0735  hypothetical protein  42.11 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.7492600000000004e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  33.65 
 
 		 154 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0921  hypothetical protein  42.11 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77995e-43 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0614  DoxD-like family  34.92 
 
 		 281 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0786  hypothetical protein  42.11 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000245891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0722  hypothetical protein  42.11 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000540501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0825  hypothetical protein  42.11 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116306  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4456  hypothetical protein  42.11 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0296685  normal  0.654993 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0879  hypothetical protein  42.11 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0735  DoxX family protein  42.11 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0648582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0990  hypothetical protein  42.11 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0667403  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  39.42 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  30.08 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  31.71 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  37.25 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0907  DoxX  45.16 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1539  DoxD family protein  35.16 
 
 		 281 aa  44.7  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.636212  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  40.2 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  40.2 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  39.62 
 
 		 239 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  37.5 
 
 		 148 aa  43.5  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  35.61 
 
 		 157 aa  42.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34190  predicted membrane protein  41 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  30.69 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  34.13 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  32.06 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  33.08 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>