213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_34190 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_34190  predicted membrane protein  100 
 
 		 167 aa  313  7e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  58.65 
 
 		 144 aa  114  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  46.92 
 
 		 148 aa  101  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0591  DoxX family protein  53.95 
 
 		 147 aa  95.1  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  41.04 
 
 		 147 aa  92  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  47.24 
 
 		 143 aa  91.7  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  43.55 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4107  DoxX family protein  55.2 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  38.35 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  37.5 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  38.85 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  38.85 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  37.31 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  40.62 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  36.57 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  32.93 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  34.13 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3003  DoxX family protein  42.64 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015102 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  37.31 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  37.41 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  41.98 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  38.71 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  48.11 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  39.85 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  35.07 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  34.33 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  32.86 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3262  DoxX family protein  42.06 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83259  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  31.97 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  34.33 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  45.04 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  35.17 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  44.86 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  35.48 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  35.81 
 
 		 378 aa  64.3  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  36.43 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  39.06 
 
 		 133 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  41.98 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  34.68 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  44.17 
 
 		 137 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  35.71 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  32.28 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  44.27 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  34.65 
 
 		 147 aa  62  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  40 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1006  DoxX family protein  44.32 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3233  DoxX family protein  37.5 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0868  DoxX  39.06 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  32.59 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  40.94 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  35.11 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  36.97 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  39.1 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  36.51 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  38.14 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  37.59 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0431  DoxX family protein  38.21 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  36.3 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  31.3 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  36.51 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  36.51 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  30.6 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  36.51 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  39.69 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  33.58 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  33.58 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  39.39 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  34.29 
 
 		 296 aa  57.4  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4541  DoxX family protein  44.19 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0910404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7264  membrane protein-like protein  45.6 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000149476  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  38.19 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  34.27 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4520  DoxX family protein  40.83 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  34.4 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  34.11 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4427  DoxX family protein  44.19 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  31.3 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  38.4 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  37.29 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2062  DoxD-like family protein  34.88 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  35 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  29.92 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4059  DoxX family protein  44.19 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  34.27 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  36.57 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  36.09 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13020  hypothetical protein  36.92 
 
 		 279 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.923899  normal  0.136283 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  33.57 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  33.57 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  32.62 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  34.29 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  29.23 
 
 		 145 aa  52.4  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2743  DoxX family protein  36.04 
 
 		 177 aa  52.4  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000157572  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08840  predicted membrane protein  35.76 
 
 		 211 aa  52.4  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.258983  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2257  DoxD-like family protein  37.21 
 
 		 144 aa  52  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.418604  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2360  DoxX family protein  43.09 
 
 		 137 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462375  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  35.81 
 
 		 145 aa  51.6  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  30.37 
 
 		 136 aa  51.2  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2492  DoxX family protein  43.09 
 
 		 137 aa  51.2  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.212338  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  36.21 
 
 		 138 aa  51.2  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>