108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2450 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2450  DoxX family protein  100 
 
 
137 aa  262  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0306678  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1834  DoxX  99.27 
 
 
137 aa  260  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2445  DoxX family protein  99.27 
 
 
137 aa  260  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  88.32 
 
 
137 aa  234  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5776  DoxX family membrane protein  96.35 
 
 
137 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2492  DoxX family protein  89.05 
 
 
137 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.212338  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2360  DoxX family protein  89.05 
 
 
137 aa  216  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462375  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  82.5 
 
 
170 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  71.94 
 
 
144 aa  191  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0698  DoxD-like family protein  82.5 
 
 
138 aa  183  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.303263  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1201  hypothetical protein  82.5 
 
 
138 aa  183  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2315  DoxD-like family protein  82.5 
 
 
138 aa  183  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0132725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2972  DoxD-like family protein  82.5 
 
 
138 aa  183  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390379  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1040  DoxX family membrane protein  82.5 
 
 
138 aa  183  7e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1046  DoxX family protein  82.5 
 
 
138 aa  183  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1627  DoxD-like family protein  82.5 
 
 
138 aa  183  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00417873  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1006  DoxX family protein  77.12 
 
 
138 aa  163  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  50 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6128  hypothetical protein  54.26 
 
 
144 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.134606 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0431  DoxX family protein  51.56 
 
 
136 aa  107  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  45.8 
 
 
133 aa  103  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4177  DoxX  51.59 
 
 
140 aa  97.1  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1372  DoxX family protein  46.46 
 
 
152 aa  97.1  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  49.52 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4512  DoxX family protein  53.38 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.794637 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4541  DoxX family protein  52.34 
 
 
131 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0910404  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4427  DoxX family protein  50 
 
 
131 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4059  DoxX family protein  50 
 
 
131 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528978  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5142  DoxX family protein  50.38 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0614  DoxD-like family  32.59 
 
 
281 aa  67.4  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1539  DoxD family protein  31.85 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.636212  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  38.93 
 
 
147 aa  62.8  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  40.22 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  41.12 
 
 
144 aa  58.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  41.54 
 
 
151 aa  57.4  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  40.68 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  42.24 
 
 
149 aa  55.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  39.86 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  39.66 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2411  DoxX-like  39.71 
 
 
154 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  36.36 
 
 
149 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  34.62 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0502  DoxX family membrane protein  41.56 
 
 
146 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  41.9 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  41.76 
 
 
133 aa  52.8  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  34.59 
 
 
148 aa  52.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  39.02 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  41.76 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  35.38 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  33.09 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  39.26 
 
 
149 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  39.66 
 
 
144 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  36.92 
 
 
149 aa  51.2  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03045  DoxX subfamily  36.46 
 
 
87 aa  51.6  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  41.86 
 
 
239 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  32.69 
 
 
131 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  38.89 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  37.3 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34190  predicted membrane protein  63.89 
 
 
167 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  38.03 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  32.54 
 
 
143 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  34.27 
 
 
136 aa  47.8  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2401  hypothetical protein  37.72 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  39.52 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  38.03 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  35.2 
 
 
157 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  33.64 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  31.78 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  34.68 
 
 
175 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  35.14 
 
 
161 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  35.14 
 
 
161 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  35.14 
 
 
161 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3589  putative inner membrane protein YqjF  35.14 
 
 
161 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.24023 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  35.14 
 
 
161 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  33.98 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  29.69 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0347  DoxX  35.11 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000430544  normal  0.0908673 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  32.81 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0758  DoxX  45 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974867  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  40 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1239  DoxX family protein  45 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  43.75 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1212  DoxX family protein  45 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  42.4 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  44.26 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  40.8 
 
 
149 aa  41.6  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3003  DoxX family protein  34.38 
 
 
150 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015102 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  44.09 
 
 
147 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  33.78 
 
 
130 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3574  putative inner membrane protein YqjF  31.08 
 
 
130 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3260  putative inner membrane protein YqjF  31.08 
 
 
130 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  33.09 
 
 
154 aa  41.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  42.06 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4331  DoxX family protein  51.22 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  37.18 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0467  DoxX family protein  39.62 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123633  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1775  DoxX family protein  30.3 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019545 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  47.14 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  33.87 
 
 
173 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2335  DoxX family protein  34.04 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>