157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1922 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  100 
 
 
149 aa  293  5e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  57.82 
 
 
154 aa  176  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  58.5 
 
 
154 aa  157  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  48.63 
 
 
146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1775  DoxX family protein  43.92 
 
 
152 aa  131  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019545 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  45.8 
 
 
154 aa  120  6e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  44.14 
 
 
153 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  44.14 
 
 
153 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  40.82 
 
 
148 aa  99.4  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  41.78 
 
 
151 aa  98.6  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  40 
 
 
145 aa  97.4  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  41.5 
 
 
144 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  44.14 
 
 
153 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  36.24 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  39.46 
 
 
144 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  43.84 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  36.73 
 
 
144 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  40.69 
 
 
144 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  40 
 
 
145 aa  89  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  41.78 
 
 
145 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  41.1 
 
 
145 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  41.78 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  37.41 
 
 
148 aa  87.8  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0883  DoxX family protein  41.55 
 
 
147 aa  88.2  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  36.91 
 
 
148 aa  86.7  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  41.5 
 
 
146 aa  86.7  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  38.73 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  35.37 
 
 
149 aa  84.3  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  35.17 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  37.84 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  37.67 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  37.76 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2062  DoxD-like family protein  41.5 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  36.05 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  37.06 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  37.06 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  36.36 
 
 
147 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  35.62 
 
 
148 aa  72  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  36.36 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  36.36 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2411  DoxX-like  42.97 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  34.46 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  35.66 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  35.37 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  32.65 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2257  DoxD-like family protein  41.5 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.418604  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  36.49 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  35.14 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  38.24 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  35.66 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2277  DoxX family protein  39.86 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  normal  0.928998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  34.72 
 
 
175 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  35.56 
 
 
174 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  34.81 
 
 
143 aa  60.5  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  36.64 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  34.35 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  34.56 
 
 
171 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0907  DoxX  50.83 
 
 
135 aa  57.4  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1057  DoxX family protein  33.08 
 
 
176 aa  56.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  35.56 
 
 
173 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  34.06 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  35.11 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  34.48 
 
 
131 aa  54.3  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3911  DoxX family protein  34.4 
 
 
189 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  36.3 
 
 
173 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  36.3 
 
 
173 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  36.3 
 
 
173 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  32.84 
 
 
180 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2743  DoxX family protein  33.61 
 
 
177 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000157572  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  38.35 
 
 
144 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  29.79 
 
 
159 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5120  DoxX family protein  33.33 
 
 
205 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  29.93 
 
 
378 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  36.09 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  30.56 
 
 
147 aa  50.4  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  30.07 
 
 
164 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  29.17 
 
 
130 aa  50.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3262  DoxX family protein  33.55 
 
 
143 aa  50.4  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83259  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  33.58 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  30.37 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  34.04 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  30.28 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  34.31 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0412  DoxX family protein  35.34 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0614  DoxD-like family  32.31 
 
 
281 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1539  DoxD family protein  31.54 
 
 
281 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.636212  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  31.58 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4427  DoxX family protein  35 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  30.43 
 
 
296 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1432  DoxX family protein  35.92 
 
 
175 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  32.39 
 
 
153 aa  47  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3322  DoxX  34.31 
 
 
180 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3384  DoxX family protein  34.31 
 
 
180 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0241193  normal  0.0518004 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  30.07 
 
 
135 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3333  DoxX family protein  34.31 
 
 
180 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671485  normal  0.176308 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  28.57 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4541  DoxX family protein  34 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0910404  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  31.06 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3233  DoxX family protein  32.09 
 
 
405 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  30.6 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>