105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1006 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1006  DoxX family protein  100 
 
 		 138 aa  265  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  80.92 
 
 		 144 aa  209  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  74.81 
 
 		 137 aa  193  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2492  DoxX family protein  78.63 
 
 		 137 aa  185  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.212338  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2360  DoxX family protein  78.03 
 
 		 137 aa  184  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462375  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1834  DoxX  76.52 
 
 		 137 aa  183  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2445  DoxX family protein  76.52 
 
 		 137 aa  183  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2450  DoxX family protein  75.76 
 
 		 137 aa  181  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0306678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5776  DoxX family membrane protein  75.76 
 
 		 137 aa  180  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  73.33 
 
 		 170 aa  174  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0698  DoxD-like family protein  75 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.303263  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1201  hypothetical protein  75 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2315  DoxD-like family protein  75 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0132725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2972  DoxD-like family protein  75 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390379  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1040  DoxX family membrane protein  75 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1046  DoxX family protein  75 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1627  DoxD-like family protein  75 
 
 		 138 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00417873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6128  hypothetical protein  55.3 
 
 		 144 aa  117  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.134606 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  46.56 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0431  DoxX family protein  56.78 
 
 		 136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  47.69 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4512  DoxX family protein  54.33 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.794637 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  48.8 
 
 		 152 aa  96.7  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4541  DoxX family protein  54.33 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0910404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4427  DoxX family protein  53.54 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1372  DoxX family protein  45.32 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4177  DoxX  51.2 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4059  DoxX family protein  52.76 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5142  DoxX family protein  52.76 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  36.3 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  36.8 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  37.21 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  38.32 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  38.52 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  34.68 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  37.6 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  35.92 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  35.71 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  38.1 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03045  DoxX subfamily  41.67 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0614  DoxD-like family  29.92 
 
 		 281 aa  53.9  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  38.18 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  37.3 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1539  DoxD family protein  29.13 
 
 		 281 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.636212  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  39.29 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34190  predicted membrane protein  46.32 
 
 		 167 aa  51.2  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  39.6 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  38.84 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  37.5 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  33.83 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  33.33 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  36.61 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  37.38 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2411  DoxX-like  40.16 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  40.44 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  35.14 
 
 		 239 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  39.69 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  40 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  37.97 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  37.97 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3003  DoxX family protein  36.51 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015102 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  31.58 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  30.89 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  36.09 
 
 		 164 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  35.16 
 
 		 135 aa  43.5  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  36.61 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0347  DoxX  29.27 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000430544  normal  0.0908673 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  39.86 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  32.79 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  33.33 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  36.61 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  36.44 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0701  DoxX family protein  39.24 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0591  DoxX family protein  38.46 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0502  DoxX family membrane protein  36.11 
 
 		 146 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  40.43 
 
 		 127 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  35.9 
 
 		 145 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  32.67 
 
 		 131 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2335  DoxX family protein  32.45 
 
 		 141 aa  41.2  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  32.69 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  35.79 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  31.97 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  32.38 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2401  hypothetical protein  35.51 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3079  DoxX family protein  39.51 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.738781  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  27.48 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  36.27 
 
 		 173 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  36.27 
 
 		 173 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  36.27 
 
 		 173 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  37.01 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  39.62 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  31.46 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  34.07 
 
 		 181 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0921  hypothetical protein  40.74 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77995e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4442  hypothetical protein  40.74 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4257  hypothetical protein  40.74 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4095  hypothetical protein  40.74 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4106  hypothetical protein  40.74 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4589  hypothetical protein  40.74 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4492  hypothetical protein  40.74 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>