121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2492 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2492  DoxX family protein  100 
 
 		 137 aa  264  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.212338  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2360  DoxX family protein  97.81 
 
 		 137 aa  238  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462375  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  86.86 
 
 		 137 aa  229  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1834  DoxX  89.78 
 
 		 137 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2445  DoxX family protein  89.78 
 
 		 137 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2450  DoxX family protein  89.05 
 
 		 137 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0306678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5776  DoxX family membrane protein  88.32 
 
 		 137 aa  216  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  81.67 
 
 		 170 aa  197  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  72.79 
 
 		 144 aa  194  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0698  DoxD-like family protein  85 
 
 		 138 aa  187  5e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.303263  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1201  hypothetical protein  85 
 
 		 138 aa  187  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2315  DoxD-like family protein  85 
 
 		 138 aa  187  5e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0132725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2972  DoxD-like family protein  85 
 
 		 138 aa  187  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390379  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1040  DoxX family membrane protein  85 
 
 		 138 aa  187  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1046  DoxX family protein  85 
 
 		 138 aa  187  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1627  DoxD-like family protein  85 
 
 		 138 aa  187  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00417873  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1006  DoxX family protein  79.66 
 
 		 138 aa  165  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6128  hypothetical protein  55.86 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.134606 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  47.73 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  48.84 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0431  DoxX family protein  54.62 
 
 		 136 aa  107  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1372  DoxX family protein  49.61 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4177  DoxX  54.84 
 
 		 140 aa  100  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4541  DoxX family protein  55.24 
 
 		 131 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0910404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  46.96 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4512  DoxX family protein  53.12 
 
 		 132 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.794637 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4427  DoxX family protein  53.33 
 
 		 131 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4059  DoxX family protein  52.38 
 
 		 131 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5142  DoxX family protein  53.33 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0614  DoxD-like family  31.11 
 
 		 281 aa  64.3  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1539  DoxD family protein  30.37 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.636212  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  34.53 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  40.46 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  35.2 
 
 		 134 aa  60.1  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  40.24 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  40.19 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  38.97 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  34.51 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03045  DoxX subfamily  38.54 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  35.46 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2411  DoxX-like  39.85 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  40.95 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  38.74 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  39.64 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  40 
 
 		 144 aa  52  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  38.24 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  37.32 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  34.35 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  39.29 
 
 		 148 aa  50.8  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  37.27 
 
 		 239 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  37.07 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  39.56 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0502  DoxX family membrane protein  38.96 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  33.67 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  30.77 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  39.56 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  39.68 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  38.1 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34190  predicted membrane protein  46.46 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  35.37 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  38.1 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  33.83 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  36.94 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  43.24 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  33.33 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  44.32 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  38.79 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2401  hypothetical protein  36.21 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  32.56 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  35.48 
 
 		 173 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  35.14 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  35.14 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  35.14 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  35.14 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3589  putative inner membrane protein YqjF  35.14 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.24023 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  33.85 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  34.68 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0591  DoxX family protein  39.84 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  33.78 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  42.86 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  39.81 
 
 		 173 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  39.81 
 
 		 173 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  35.48 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  39.81 
 
 		 173 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3574  putative inner membrane protein YqjF  31.08 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4331  DoxX family protein  36.49 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3260  putative inner membrane protein YqjF  31.08 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  33.98 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0347  DoxX  34.04 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000430544  normal  0.0908673 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  35.58 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  34.65 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  28.24 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1775  DoxX family protein  29.85 
 
 		 152 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.019545 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3262  DoxX family protein  42.42 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83259  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  31.08 
 
 		 160 aa  41.6  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  31.08 
 
 		 160 aa  41.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.260448 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02970  predicted quinol oxidase subunit  31.08 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0600  DoxX family protein  31.08 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02921  hypothetical protein  31.08 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0544  DoxX family protein  30.86 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>