60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0687 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0687  DoxX  100 
 
 
134 aa  254  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  55.22 
 
 
134 aa  144  6e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  54.4 
 
 
131 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  55.04 
 
 
128 aa  130  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  50 
 
 
144 aa  122  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  52 
 
 
130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  52.8 
 
 
130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  52.8 
 
 
157 aa  111  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  44.19 
 
 
149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  43.51 
 
 
138 aa  110  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  48.44 
 
 
140 aa  110  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  48.09 
 
 
138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  42.11 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0915  DoxX  50.83 
 
 
131 aa  108  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  53.78 
 
 
131 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  44.09 
 
 
134 aa  105  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2974  DoxX  52 
 
 
134 aa  105  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00548742  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  42.54 
 
 
144 aa  101  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  42.54 
 
 
144 aa  101  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3963  DoxX family protein  50 
 
 
114 aa  100  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804647  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  41.22 
 
 
143 aa  99  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  41.79 
 
 
143 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  37.31 
 
 
140 aa  95.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  41.79 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  45.83 
 
 
137 aa  90.9  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  39.69 
 
 
143 aa  90.5  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  37.8 
 
 
127 aa  87.4  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  44.88 
 
 
150 aa  87  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  36.72 
 
 
128 aa  87  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  37.69 
 
 
127 aa  86.7  9e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  44.35 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2122  DoxX family protein  42.74 
 
 
129 aa  84.3  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1661  DoxX  36.29 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0176  SRC kinase associated phosphoprotein 2  32.17 
 
 
129 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.479419  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  32.26 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  33.06 
 
 
172 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  34.38 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  34.38 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  29.32 
 
 
148 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  34.38 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  33.06 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  29.46 
 
 
185 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  32.03 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  29.46 
 
 
185 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02881  hypothetical protein  30.37 
 
 
186 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  25.6 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  33.72 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0267  hypothetical protein  29.63 
 
 
186 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02871  hypothetical protein  29.63 
 
 
186 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.714602  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7016  DoxX family protein  30.66 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  31.5 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  32.18 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3606  DoxX family protein  29.55 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142156  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5722  DoxX family protein  33.59 
 
 
137 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.486124  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0431  DoxX family protein  37.07 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  32.18 
 
 
183 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  32.18 
 
 
183 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02981  hypothetical protein  29.32 
 
 
186 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.925648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  26.67 
 
 
154 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>