41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2122 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2122  DoxX family protein  100 
 
 		 129 aa  250  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0915  DoxX  50 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  52.38 
 
 		 137 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  52.25 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  42.98 
 
 		 143 aa  106  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  45.61 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  43.97 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  42.24 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  48.65 
 
 		 137 aa  104  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  46.96 
 
 		 131 aa  103  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  46.96 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  41.38 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  48.57 
 
 		 130 aa  102  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  43.8 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  39.66 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  45.61 
 
 		 144 aa  94.7  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  43.86 
 
 		 140 aa  93.6  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  47.22 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  40.16 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  40 
 
 		 136 aa  90.9  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  36.21 
 
 		 140 aa  90.1  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  42.74 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  36.97 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  41 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2974  DoxX  47.66 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00548742  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  37.82 
 
 		 134 aa  83.6  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  36.28 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3963  DoxX family protein  41.05 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804647  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  35.96 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  35.09 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  36.27 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  31.86 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1661  DoxX  31.09 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0176  SRC kinase associated phosphoprotein 2  28.04 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.479419  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  40.26 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  35.34 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5722  DoxX family protein  41.94 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.486124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  30.3 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  35.35 
 
 		 152 aa  43.5  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  36.97 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  31.07 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>