68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1594 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  100 
 
 		 137 aa  264  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  61.31 
 
 		 157 aa  162  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  68.61 
 
 		 137 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  53.72 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  59.65 
 
 		 131 aa  123  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  48.09 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  50 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  48.44 
 
 		 134 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  50.82 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  47.33 
 
 		 138 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  45.04 
 
 		 140 aa  113  8.999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  47.93 
 
 		 130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  43.18 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  45.53 
 
 		 136 aa  103  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  46.56 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  45.76 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2974  DoxX  46.88 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00548742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  42.62 
 
 		 143 aa  100  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  41.09 
 
 		 140 aa  97.4  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  38.17 
 
 		 143 aa  97.1  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  42.62 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  41.67 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  39.17 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2122  DoxX family protein  48.33 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0915  DoxX  42.11 
 
 		 131 aa  92.8  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  37.7 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3963  DoxX family protein  42.61 
 
 		 114 aa  90.1  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804647  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  39.2 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  39.34 
 
 		 134 aa  87  8e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  36.5 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1661  DoxX  38.1 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  36.64 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  38.33 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0176  SRC kinase associated phosphoprotein 2  37.27 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.479419  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  42.15 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  36.96 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  33.33 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  30.53 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  32.56 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6128  hypothetical protein  37.37 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.134606 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02921  hypothetical protein  30.3 
 
 		 190 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  34.11 
 
 		 172 aa  46.2  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  31.82 
 
 		 296 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  30.58 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  35.2 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  34.07 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4945  DoxX family protein  33.59 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  35.2 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  35.2 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  32.03 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  31.54 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  29.23 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  33.6 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  31.54 
 
 		 137 aa  42.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2914  DoxX family protein  32.84 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03431  hypothetical protein  28.46 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1631  hypothetical protein  28.46 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  30.95 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  35.2 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  32.46 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  33.05 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  31.75 
 
 		 181 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  32.26 
 
 		 154 aa  42  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  30.95 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  28.45 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  33.09 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0267  hypothetical protein  29.86 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  30.28 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>