60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1247 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  100 
 
 		 143 aa  283  5.999999999999999e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  86.43 
 
 		 140 aa  249  9.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  72.73 
 
 		 143 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  69.23 
 
 		 143 aa  199  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  56.43 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  53.47 
 
 		 144 aa  147  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  54.17 
 
 		 144 aa  146  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  56.39 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  53.28 
 
 		 131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  50.79 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  49.22 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  45.74 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  48.06 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  45.8 
 
 		 157 aa  115  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  41.73 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0915  DoxX  51.69 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  46.56 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  47.83 
 
 		 131 aa  110  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  41.79 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  40.74 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  39.06 
 
 		 138 aa  103  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  41.94 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  41.22 
 
 		 134 aa  99  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3963  DoxX family protein  45.13 
 
 		 114 aa  97.4  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804647  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  44.14 
 
 		 137 aa  97.1  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  39.53 
 
 		 150 aa  94  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2122  DoxX family protein  39.66 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2974  DoxX  42.64 
 
 		 134 aa  90.5  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00548742  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  37.59 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  34.62 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  38.68 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  36.92 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1661  DoxX  33.88 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  34.78 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0176  SRC kinase associated phosphoprotein 2  29.2 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.479419  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  31.97 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  31.5 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5722  DoxX family protein  35.29 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.486124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  35.11 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  32.23 
 
 		 161 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  31.82 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  32.09 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  34.44 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  30.37 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  29.06 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  34.02 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  36.73 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  28.93 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  30.69 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  30.69 
 
 		 153 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  29.01 
 
 		 153 aa  42.7  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  34.15 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  34.15 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  32.5 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  34.15 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  33.57 
 
 		 180 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  32.85 
 
 		 149 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  31.16 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  29.03 
 
 		 147 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  31.3 
 
 		 144 aa  40  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>