74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2799 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  100 
 
 
144 aa  284  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  71.53 
 
 
144 aa  209  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  70.83 
 
 
144 aa  208  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  54.14 
 
 
143 aa  144  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  56.39 
 
 
143 aa  142  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  51.13 
 
 
140 aa  138  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  49.31 
 
 
144 aa  136  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  48.87 
 
 
143 aa  135  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  48 
 
 
128 aa  123  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  50.41 
 
 
157 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  42.75 
 
 
149 aa  121  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  48.03 
 
 
140 aa  119  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  48 
 
 
138 aa  117  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  46.28 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  46.77 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  42.75 
 
 
136 aa  114  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  45.45 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  44.19 
 
 
134 aa  111  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  48.28 
 
 
131 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  40.31 
 
 
138 aa  105  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  43.59 
 
 
137 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  40.32 
 
 
127 aa  103  8e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0915  DoxX  44 
 
 
131 aa  103  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  41.79 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2122  DoxX family protein  43.09 
 
 
129 aa  99.4  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3963  DoxX family protein  41.59 
 
 
114 aa  93.2  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804647  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2974  DoxX  45.08 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00548742  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  37.5 
 
 
150 aa  90.1  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  34.88 
 
 
134 aa  87.4  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  35.71 
 
 
127 aa  87  8e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  39.42 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1661  DoxX  35.48 
 
 
132 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  31.82 
 
 
128 aa  77  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0176  SRC kinase associated phosphoprotein 2  35.4 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.479419  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  32.26 
 
 
133 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  37.01 
 
 
154 aa  52  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  36.59 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  29.75 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  32.58 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  33.06 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  31.01 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  32.35 
 
 
296 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2173  DoxX family protein  36.78 
 
 
161 aa  44.7  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529053  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  32.26 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  31.62 
 
 
181 aa  43.5  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  29.01 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  31.71 
 
 
172 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0431  DoxX family protein  30.4 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  29.85 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  31.79 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  37.5 
 
 
172 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  29.67 
 
 
152 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1436  DoxX family protein  28.67 
 
 
164 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0735  hypothetical protein  40.91 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.7492600000000004e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  29.32 
 
 
144 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4241  DoxX family protein  35.07 
 
 
297 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0786  hypothetical protein  40.91 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000245891  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  29.29 
 
 
185 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0825  hypothetical protein  40.91 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116306  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0921  hypothetical protein  40.91 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77995e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4456  hypothetical protein  40.91 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0296685  normal  0.654993 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0879  hypothetical protein  40.91 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0990  hypothetical protein  40.91 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0667403  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0735  DoxX family protein  40.91 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0648582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4441  hypothetical protein  40.91 
 
 
134 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4589  hypothetical protein  40.91 
 
 
134 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0756  hypothetical protein  40.91 
 
 
134 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4480  hypothetical protein  40.91 
 
 
134 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4492  hypothetical protein  40.91 
 
 
134 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4106  hypothetical protein  40.91 
 
 
134 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0722  hypothetical protein  40.91 
 
 
134 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000540501  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4095  hypothetical protein  40.91 
 
 
134 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4257  hypothetical protein  40.91 
 
 
134 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4442  hypothetical protein  40.91 
 
 
134 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>