99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1889 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  100 
 
 		 150 aa  298  2e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  66.42 
 
 		 138 aa  184  3e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  57.72 
 
 		 149 aa  183  7e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  66.18 
 
 		 136 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  61.31 
 
 		 138 aa  170  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  52.63 
 
 		 140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  50 
 
 		 157 aa  127  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  45.04 
 
 		 130 aa  120  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  40.46 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  41.22 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  46.77 
 
 		 130 aa  117  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  45.97 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  45.67 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  42.64 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  44.7 
 
 		 128 aa  115  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  38.69 
 
 		 144 aa  112  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  39.53 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  48.65 
 
 		 137 aa  110  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  38.76 
 
 		 140 aa  110  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  39.53 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  41.48 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  42.4 
 
 		 127 aa  107  6e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0915  DoxX  44.25 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  41.35 
 
 		 134 aa  104  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  44.88 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  45.13 
 
 		 131 aa  102  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  49.06 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3963  DoxX family protein  42.61 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804647  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  38.93 
 
 		 144 aa  97.4  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2974  DoxX  43.55 
 
 		 134 aa  95.5  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00548742  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  38.1 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1661  DoxX  36.72 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2122  DoxX family protein  39.47 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  35.25 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  31.54 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  32.09 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0176  SRC kinase associated phosphoprotein 2  32.11 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.479419  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02981  hypothetical protein  27.63 
 
 		 186 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.925648  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  32.85 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  30.15 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  28.15 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  32.33 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  31.11 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  33.6 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02881  hypothetical protein  28 
 
 		 186 aa  50.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0267  hypothetical protein  26.4 
 
 		 186 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  38.76 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02871  hypothetical protein  27.2 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.714602  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  33.33 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4177  DoxX  33.86 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  28.21 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  33.85 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  33.85 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  33.85 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3679  DoxX  31.39 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  35.44 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  33.33 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  33.59 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  31.21 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02921  hypothetical protein  29.69 
 
 		 190 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6128  hypothetical protein  36.08 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.134606 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  31.39 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  33.73 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4441  hypothetical protein  34.51 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  30.4 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  24.41 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0756  hypothetical protein  34.51 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4492  hypothetical protein  34.51 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4480  hypothetical protein  34.51 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4589  hypothetical protein  34.51 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  30.28 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  29.6 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4208  DoxX family protein  34.51 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.550603  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4497  DoxX family protein  35.29 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4257  hypothetical protein  34.51 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4095  hypothetical protein  34.51 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4442  hypothetical protein  34.51 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4106  hypothetical protein  34.51 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  30.71 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  31.15 
 
 		 185 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  33.73 
 
 		 172 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  30.89 
 
 		 185 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3079  DoxX family protein  31.97 
 
 		 134 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.738781  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  32.06 
 
 		 149 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  32.69 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  30.23 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  30.94 
 
 		 149 aa  41.2  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0431  DoxX family protein  33.06 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  31.3 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  31.58 
 
 		 144 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  29.23 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  32.56 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  33.02 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2995  DoxX family protein  28.15 
 
 		 143 aa  40  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00203576  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  32.33 
 
 		 144 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  31.78 
 
 		 148 aa  40  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>