106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2974 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2974  DoxX  100 
 
 		 134 aa  256  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00548742  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  68 
 
 		 130 aa  169  7.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  64.39 
 
 		 131 aa  169  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  63.71 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  59.2 
 
 		 128 aa  136  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  54.84 
 
 		 157 aa  130  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  58.41 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  50.79 
 
 		 134 aa  123  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  52 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  43.55 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  47.58 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  45.08 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  44.26 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  47.01 
 
 		 137 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  44.63 
 
 		 140 aa  106  9.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  45.54 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  42.64 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  45.97 
 
 		 138 aa  104  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  39.84 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  39.53 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3963  DoxX family protein  50 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804647  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  45.08 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  43.85 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  41.54 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  37.3 
 
 		 127 aa  100  9e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  41.27 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0915  DoxX  46.09 
 
 		 131 aa  98.6  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  43.33 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  41.07 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  39.55 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2122  DoxX family protein  46.79 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1661  DoxX  37.7 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  36.07 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0176  SRC kinase associated phosphoprotein 2  33.91 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.479419  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  38.21 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  32.09 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  32.09 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  34.68 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  39.02 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  32.84 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  33.87 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  32.8 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  35.34 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  30.43 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  38.33 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  31.75 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  31.58 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  29.01 
 
 		 144 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  31.3 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  25.42 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  29.92 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  31.67 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  32.59 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  32.82 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  27.82 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  32.82 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  32.06 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  32.84 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3233  DoxX family protein  30.66 
 
 		 405 aa  44.3  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4257  hypothetical protein  44 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4095  hypothetical protein  44 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4106  hypothetical protein  44 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4589  hypothetical protein  44 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4208  DoxX family protein  44 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.550603  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4480  hypothetical protein  45.65 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0756  hypothetical protein  45.65 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4441  hypothetical protein  44 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4442  hypothetical protein  44 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  31.43 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4492  hypothetical protein  44 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  35.59 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  31.31 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  32.5 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  26.89 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  31.91 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  32.5 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  32.5 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13020  hypothetical protein  34.35 
 
 		 279 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.923899  normal  0.136283 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  28.03 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3079  DoxX family protein  44 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.738781  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  30.65 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  34.15 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0786  hypothetical protein  43.48 
 
 		 134 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000245891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0722  hypothetical protein  43.48 
 
 		 134 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000540501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0825  hypothetical protein  43.48 
 
 		 134 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116306  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  34.35 
 
 		 180 aa  41.6  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  33.33 
 
 		 133 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  24.59 
 
 		 132 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0735  DoxX family protein  43.48 
 
 		 134 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0648582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0990  hypothetical protein  43.48 
 
 		 134 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0667403  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0879  hypothetical protein  43.48 
 
 		 134 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4456  hypothetical protein  43.48 
 
 		 134 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0296685  normal  0.654993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  28.79 
 
 		 296 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  31.06 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  32.84 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  35.94 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0735  hypothetical protein  41.3 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.7492600000000004e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  30.47 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  29.55 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0921  hypothetical protein  41.3 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77995e-43 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>