178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4811 on replicon NC_013746
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  100 
 
 
161 aa  314  4e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  44.37 
 
 
148 aa  110  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  41.98 
 
 
150 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  40.48 
 
 
143 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  43.31 
 
 
133 aa  101  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1630  DoxX family protein  41.09 
 
 
140 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  40 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  37.5 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  45.9 
 
 
132 aa  94.4  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2244  DoxX  40.31 
 
 
140 aa  94  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201845  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  46.85 
 
 
140 aa  93.6  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  39.17 
 
 
133 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  40 
 
 
133 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  43.36 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  39.68 
 
 
130 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  40 
 
 
136 aa  87.4  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  44.25 
 
 
133 aa  86.3  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1219  DoxX family protein  36.52 
 
 
156 aa  85.5  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.901202  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2062  DoxX  42.5 
 
 
125 aa  84.7  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  40.83 
 
 
131 aa  84.7  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3322  DoxX  41.86 
 
 
180 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3384  DoxX family protein  41.86 
 
 
180 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0241193  normal  0.0518004 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3333  DoxX family protein  41.86 
 
 
180 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671485  normal  0.176308 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  36.8 
 
 
131 aa  83.6  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  36.29 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  40 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1879  DoxX family protein  42.86 
 
 
130 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0371947 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2914  DoxX family protein  40 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0094  DoxX family protein  41.53 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  39.2 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  42.15 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13081  integral membrane protein  40.48 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0684  DoxX  39.17 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000773987  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2451  hypothetical protein  44.35 
 
 
132 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  45.45 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0868  DoxX  40.16 
 
 
136 aa  73.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  33.59 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  40.98 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7016  DoxX family protein  32.14 
 
 
153 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  38.76 
 
 
149 aa  72  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  43.8 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3606  DoxX family protein  34.85 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142156  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3702  DoxX family protein  35.2 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.955639 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  44.63 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  43.8 
 
 
145 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  37.01 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  43.07 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4945  DoxX family protein  32.17 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3404  DoxX family protein  37.17 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.246337 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1514  DoxX  37.01 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  35.42 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  35.42 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  35.42 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  35.43 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4607  DoxX family protein  38.79 
 
 
136 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238315  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  39.5 
 
 
144 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  37.5 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  35.21 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3841  DoxX family protein  31.71 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0576  DoxX family protein  38.71 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468844  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  37.5 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  37.82 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  35.46 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  39.31 
 
 
148 aa  63.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  43.31 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  35.29 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  39.55 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1455  DoxX  35.25 
 
 
136 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  42.28 
 
 
147 aa  62  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  40.16 
 
 
147 aa  61.2  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6801  hypothetical protein  33.59 
 
 
134 aa  61.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  38.46 
 
 
147 aa  60.5  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0839  DoxX family protein  30.65 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.496413 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  40.94 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  33.79 
 
 
164 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  29.94 
 
 
161 aa  57.4  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  40.16 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  40.16 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  40.16 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  35.94 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  34.06 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  33.58 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  39.68 
 
 
150 aa  55.1  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  37.01 
 
 
148 aa  55.1  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  35.16 
 
 
180 aa  55.1  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  41.8 
 
 
150 aa  55.1  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  35.82 
 
 
148 aa  54.7  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  40.68 
 
 
138 aa  53.9  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  29.76 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  29.76 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  29.76 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  36.36 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  33.33 
 
 
154 aa  52.4  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  34.85 
 
 
378 aa  52.4  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  36.51 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3589  putative inner membrane protein YqjF  29.76 
 
 
161 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.24023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  35.59 
 
 
141 aa  51.6  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1425  DoxX family protein  32.59 
 
 
154 aa  50.8  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.305544  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2411  DoxX-like  43.09 
 
 
154 aa  50.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  33.59 
 
 
137 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>