184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0526 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  100 
 
 		 154 aa  311  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  92.86 
 
 		 154 aa  292  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  58.5 
 
 		 149 aa  174  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  57.93 
 
 		 146 aa  169  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1775  DoxX family protein  48.98 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.019545 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  48.53 
 
 		 148 aa  121  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  46.88 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  48.34 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  50.35 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  48.55 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  46.38 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  48.94 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  42.47 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  41.78 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  40.41 
 
 		 151 aa  95.5  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  39.86 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  40.41 
 
 		 144 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0883  DoxX family protein  43.85 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  38.19 
 
 		 149 aa  92.8  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  40.56 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  39.73 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  40.97 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  38.89 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  37.5 
 
 		 149 aa  90.9  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  40 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  40 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2411  DoxX-like  46.26 
 
 		 154 aa  87.4  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  40.77 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  40.16 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  40.43 
 
 		 146 aa  84  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  41.78 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  40.56 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2062  DoxD-like family protein  43.45 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  40.41 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  41.72 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  42.64 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  41.73 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  34.69 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  35.62 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  38.81 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  35.37 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  35.37 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2257  DoxD-like family protein  43.84 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.418604  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  37.68 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  41.73 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  38.97 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  37.59 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  35.62 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  34.97 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  34.97 
 
 		 147 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  34.97 
 
 		 147 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2277  DoxX family protein  41.43 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  normal  0.928998 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  38.93 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  32.59 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  39.26 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1057  DoxX family protein  34.06 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  34.75 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  36.84 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  38.41 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  35.77 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  38.41 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  38.41 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  31.91 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  32.67 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  34.75 
 
 		 378 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  32.89 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  28.15 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  30.07 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0907  DoxX  45 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3322  DoxX  35.21 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3384  DoxX family protein  35.21 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0241193  normal  0.0518004 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  35.56 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3333  DoxX family protein  35.21 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671485  normal  0.176308 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  34.53 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5120  DoxX family protein  33.56 
 
 		 205 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  31.47 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  33.08 
 
 		 159 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  36.09 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  33.96 
 
 		 196 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  34.04 
 
 		 196 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  34.55 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5119  DoxX family protein  37.61 
 
 		 128 aa  50.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000103447  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  33.68 
 
 		 216 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  31.16 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  34.59 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  31.37 
 
 		 197 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  33.33 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  30.61 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13020  hypothetical protein  27.74 
 
 		 279 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.923899  normal  0.136283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1493  DoxX  30.83 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  30 
 
 		 197 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1515  DoxX family protein  30.83 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3911  DoxX family protein  38.26 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3842  DoxX family protein  37.61 
 
 		 128 aa  48.9  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000608334  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3233  DoxX family protein  32.84 
 
 		 405 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4503  DoxX  40.6 
 
 		 197 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  30.5 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  33.68 
 
 		 202 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  34.04 
 
 		 197 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2401  hypothetical protein  32.76 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>