79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0945 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  100 
 
 
136 aa  267  5e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  70.77 
 
 
149 aa  191  4e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  67.16 
 
 
138 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  66.42 
 
 
138 aa  180  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  66.18 
 
 
150 aa  165  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  60.16 
 
 
140 aa  157  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  44.62 
 
 
144 aa  122  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  43.85 
 
 
144 aa  121  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  44.44 
 
 
144 aa  121  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  46.03 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  50.81 
 
 
130 aa  118  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  47.33 
 
 
128 aa  117  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  42.54 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  47.58 
 
 
131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  40 
 
 
143 aa  112  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  44.35 
 
 
130 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  46.15 
 
 
157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  42.11 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  40.74 
 
 
143 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  42.11 
 
 
134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  42.75 
 
 
144 aa  107  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  44 
 
 
127 aa  107  8.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  37.04 
 
 
140 aa  105  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0915  DoxX  46.49 
 
 
131 aa  104  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  38.64 
 
 
134 aa  104  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3963  DoxX family protein  42.48 
 
 
114 aa  101  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804647  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2974  DoxX  47.58 
 
 
134 aa  94.7  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00548742  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1661  DoxX  37.21 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  42.98 
 
 
131 aa  93.6  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  40.18 
 
 
137 aa  93.2  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  43.4 
 
 
137 aa  87  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  33.6 
 
 
127 aa  84.7  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2122  DoxX family protein  40 
 
 
129 aa  79  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0176  SRC kinase associated phosphoprotein 2  34.65 
 
 
129 aa  52.8  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.479419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  29.85 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  32.59 
 
 
146 aa  52  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  33.1 
 
 
147 aa  51.2  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  34.31 
 
 
153 aa  50.4  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  33.33 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  31.39 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  33.08 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  34.81 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  34.81 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  31.85 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  30.6 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  31.01 
 
 
137 aa  44.3  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  28.03 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  29.1 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02871  hypothetical protein  28.91 
 
 
186 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.714602  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  31.58 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5453  DoxX family protein  29.01 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.403659  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  29.92 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  28.33 
 
 
138 aa  42.7  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  32.59 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0267  hypothetical protein  27.34 
 
 
186 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5722  DoxX family protein  35.07 
 
 
137 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.486124  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02881  hypothetical protein  28.12 
 
 
186 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02921  hypothetical protein  29.2 
 
 
190 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  27.46 
 
 
136 aa  41.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  26.52 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  26.77 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  29.46 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  32.09 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  29.13 
 
 
172 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  30.47 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  32.84 
 
 
144 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  30.47 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4480  hypothetical protein  34.95 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0756  hypothetical protein  34.95 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4589  hypothetical protein  34.95 
 
 
134 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4492  hypothetical protein  34.95 
 
 
134 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4106  hypothetical protein  34.95 
 
 
134 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4095  hypothetical protein  34.95 
 
 
134 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4257  hypothetical protein  34.95 
 
 
134 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3079  DoxX family protein  32.04 
 
 
134 aa  40  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.738781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4441  hypothetical protein  34.95 
 
 
134 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4442  hypothetical protein  34.95 
 
 
134 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  30.47 
 
 
139 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4208  DoxX family protein  34.95 
 
 
134 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.550603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>