64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0131 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  95.68 
 
 
185 aa  348  2e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  60.64 
 
 
183 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  59.68 
 
 
183 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  60.33 
 
 
182 aa  191  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  63.95 
 
 
172 aa  190  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  59.36 
 
 
188 aa  189  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  63.12 
 
 
172 aa  171  5.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  44.09 
 
 
181 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3679  DoxX  42.28 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244445  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  33.87 
 
 
137 aa  67.4  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03431  hypothetical protein  31.11 
 
 
177 aa  58.2  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1631  hypothetical protein  31.11 
 
 
177 aa  57.8  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  36.17 
 
 
197 aa  57.8  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  34.02 
 
 
216 aa  55.5  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0267  hypothetical protein  30.07 
 
 
186 aa  55.5  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02871  hypothetical protein  30.07 
 
 
186 aa  55.5  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.714602  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02881  hypothetical protein  29.37 
 
 
186 aa  54.3  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02921  hypothetical protein  30.15 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3233  DoxX family protein  35.34 
 
 
405 aa  52  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  35.83 
 
 
136 aa  51.6  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  36.73 
 
 
198 aa  51.6  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  31.45 
 
 
154 aa  51.2  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  35.11 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  34.74 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02981  hypothetical protein  30.07 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.925648  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  33.33 
 
 
153 aa  50.1  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  36.17 
 
 
198 aa  49.3  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  29.2 
 
 
159 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  32.98 
 
 
202 aa  48.5  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5936  DoxX family protein  30.65 
 
 
172 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24841  hypothetical protein  31.62 
 
 
141 aa  48.5  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4241  DoxX family protein  32 
 
 
297 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  32.98 
 
 
197 aa  48.5  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  36.84 
 
 
196 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  34.68 
 
 
143 aa  48.1  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  30.71 
 
 
134 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  31.08 
 
 
180 aa  47.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  36.84 
 
 
196 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  28.57 
 
 
296 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  28.03 
 
 
164 aa  45.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  32.03 
 
 
131 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  29.69 
 
 
148 aa  45.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1172  DoxX family protein  29.58 
 
 
155 aa  45.1  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1556  DoxX family protein  43.28 
 
 
199 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1739  DoxX family protein  37.5 
 
 
196 aa  44.7  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  29.46 
 
 
134 aa  44.7  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  31.91 
 
 
197 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  32 
 
 
138 aa  44.3  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08840  predicted membrane protein  35.21 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.258983  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  30.77 
 
 
147 aa  44.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  27.27 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  33.61 
 
 
128 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  29.71 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  34.07 
 
 
145 aa  42.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  29.84 
 
 
167 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  27.59 
 
 
136 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  31.45 
 
 
140 aa  42  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  28.38 
 
 
145 aa  41.6  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  36.05 
 
 
133 aa  41.6  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  31.03 
 
 
137 aa  41.2  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  28.41 
 
 
204 aa  40.8  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0320  DoxX family protein  25 
 
 
144 aa  40.8  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0983  DoxX family protein  27.61 
 
 
142 aa  40.8  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382706  normal  0.727825 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>