114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0104 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  100 
 
 		 147 aa  293  8e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  69.13 
 
 		 150 aa  205  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1219  DoxX family protein  68.38 
 
 		 156 aa  200  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.901202  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  49.31 
 
 		 143 aa  140  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4945  DoxX family protein  48.53 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3606  DoxX family protein  50 
 
 		 143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  45.38 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0094  DoxX family protein  44.27 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7016  DoxX family protein  50.4 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  43.06 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13081  integral membrane protein  48.36 
 
 		 141 aa  103  9e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3322  DoxX  43.85 
 
 		 180 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3384  DoxX family protein  43.85 
 
 		 180 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0241193  normal  0.0518004 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3333  DoxX family protein  43.85 
 
 		 180 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671485  normal  0.176308 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2914  DoxX family protein  44.85 
 
 		 185 aa  100  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  37.5 
 
 		 161 aa  95.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  40.6 
 
 		 133 aa  94.7  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  44.44 
 
 		 130 aa  94.4  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  41.27 
 
 		 133 aa  94.4  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  39.2 
 
 		 135 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  41.03 
 
 		 133 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  40.17 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  42.86 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  44.44 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  39.23 
 
 		 134 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  39.2 
 
 		 131 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  41.18 
 
 		 136 aa  87  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2062  DoxX  43.2 
 
 		 125 aa  87  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0839  DoxX family protein  34.53 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496413 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1630  DoxX family protein  42.74 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  38.1 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2451  hypothetical protein  42.74 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0868  DoxX  39.34 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  34.68 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2244  DoxX  41.88 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201845  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0684  DoxX  35.61 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000773987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1514  DoxX  41.73 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1879  DoxX family protein  39.84 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371947 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0576  DoxX family protein  40.83 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6801  hypothetical protein  35.77 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4607  DoxX family protein  41.35 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238315  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3841  DoxX family protein  33.88 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1455  DoxX  38.17 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  34.68 
 
 		 130 aa  67  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3404  DoxX family protein  36.89 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.246337 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3702  DoxX family protein  32.79 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.955639 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  35.88 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  36 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  33.6 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  35.66 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  30.66 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  32.8 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  35.11 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  31.62 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  37.3 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  31.75 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  34.38 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  34.35 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  31.3 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  34.35 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  34 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  36 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  30.77 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  32.54 
 
 		 144 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  35.71 
 
 		 147 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  35.71 
 
 		 147 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  34.92 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  36.22 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2257  DoxD-like family protein  35.16 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.418604  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  31.25 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  35.43 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  33.87 
 
 		 175 aa  48.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  34.4 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  28.57 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  34.4 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2062  DoxD-like family protein  34.38 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  37.3 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  31.25 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  34.4 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  34.4 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  28.21 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  33.07 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  32.28 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  26.98 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  25.21 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  29.06 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  33.08 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2277  DoxX family protein  35.46 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  normal  0.928998 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  34.4 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  27.97 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  30.58 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  31.75 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34190  predicted membrane protein  34.65 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  29.57 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  28.7 
 
 		 140 aa  42.7  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  27.48 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  29.93 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  29.51 
 
 		 144 aa  42  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  23.33 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  26.98 
 
 		 160 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>