113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2202 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  100 
 
 
144 aa  279  8.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  72.03 
 
 
137 aa  191  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1006  DoxX family protein  88 
 
 
138 aa  178  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2492  DoxX family protein  72.79 
 
 
137 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.212338  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  76.79 
 
 
170 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2360  DoxX family protein  72.46 
 
 
137 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462375  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1834  DoxX  72.79 
 
 
137 aa  176  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2445  DoxX family protein  72.79 
 
 
137 aa  176  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5776  DoxX family membrane protein  72.66 
 
 
137 aa  176  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2450  DoxX family protein  71.94 
 
 
137 aa  174  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0306678  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0698  DoxD-like family protein  74.58 
 
 
138 aa  160  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.303263  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1201  hypothetical protein  74.58 
 
 
138 aa  160  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2315  DoxD-like family protein  74.58 
 
 
138 aa  160  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0132725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2972  DoxD-like family protein  74.58 
 
 
138 aa  160  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.390379  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1040  DoxX family membrane protein  74.58 
 
 
138 aa  160  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1046  DoxX family protein  74.58 
 
 
138 aa  160  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1627  DoxD-like family protein  74.58 
 
 
138 aa  160  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00417873  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0431  DoxX family protein  57.85 
 
 
136 aa  124  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  50 
 
 
133 aa  123  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6128  hypothetical protein  53.57 
 
 
144 aa  116  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.134606 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  52.38 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4177  DoxX  52.71 
 
 
140 aa  107  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  51.43 
 
 
152 aa  102  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4512  DoxX family protein  53.12 
 
 
132 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.794637 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1372  DoxX family protein  46.36 
 
 
152 aa  97.4  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4541  DoxX family protein  51.85 
 
 
131 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0910404  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4427  DoxX family protein  50 
 
 
131 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4059  DoxX family protein  49.23 
 
 
131 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528978  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5142  DoxX family protein  50 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  33.57 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  39.13 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  36.22 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  38.26 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  36.72 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0614  DoxD-like family  32.8 
 
 
281 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  37.39 
 
 
149 aa  57  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  38.58 
 
 
149 aa  57  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03045  DoxX subfamily  38.54 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  46.46 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  35.34 
 
 
141 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1539  DoxD family protein  30.15 
 
 
281 aa  55.8  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.636212  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  36.13 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  38.18 
 
 
148 aa  54.7  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  39.42 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  35.21 
 
 
144 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  36.36 
 
 
139 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  35.21 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34190  predicted membrane protein  48.96 
 
 
167 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  34.12 
 
 
133 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  34.95 
 
 
131 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  36.21 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  33.33 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0701  DoxX family protein  43.04 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  33.62 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  36.56 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  30.37 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  33.62 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  36.8 
 
 
173 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  33.62 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  35.42 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  38.78 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5120  DoxX family protein  36.64 
 
 
205 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  33.98 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  36 
 
 
196 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2401  hypothetical protein  37.72 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2411  DoxX-like  40 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  40.15 
 
 
149 aa  47.8  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  36.8 
 
 
174 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  36.17 
 
 
196 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2335  DoxX family protein  32.87 
 
 
141 aa  47  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  40.78 
 
 
173 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  40.78 
 
 
173 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  40.78 
 
 
173 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  31.86 
 
 
154 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  37.89 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  39.57 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  37.89 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3262  DoxX family protein  39.83 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83259  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0502  DoxX family membrane protein  37.5 
 
 
146 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  34.44 
 
 
164 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  33.73 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  36 
 
 
171 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  35.77 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  36.9 
 
 
161 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  36.9 
 
 
161 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3589  putative inner membrane protein YqjF  36.9 
 
 
161 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.24023 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  36.9 
 
 
161 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  29.27 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  33.98 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  35.24 
 
 
239 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0591  DoxX family protein  36.3 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  36.9 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3346  DoxX family protein  38.89 
 
 
206 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  36.9 
 
 
129 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2850  DoxX  49.06 
 
 
120 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  35.94 
 
 
135 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  29.91 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4331  DoxX family protein  47.27 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2062  DoxD-like family protein  39.62 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  37.31 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>