60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1588 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  100 
 
 		 239 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7103  membrane protein-like protein  33.57 
 
 		 274 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0284087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  43.84 
 
 		 143 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  45 
 
 		 141 aa  99.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7264  membrane protein-like protein  43.64 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000149476  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3003  DoxX family protein  41.94 
 
 		 150 aa  85.5  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4520  DoxX family protein  42.77 
 
 		 146 aa  85.1  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  44.76 
 
 		 144 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4107  DoxX family protein  45.8 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  38.58 
 
 		 148 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  34.75 
 
 		 134 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3262  DoxX family protein  48.25 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83259  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  35.77 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  36.76 
 
 		 171 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  38.06 
 
 		 149 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  38.69 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  39.57 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  37.88 
 
 		 133 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  34.33 
 
 		 148 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  36 
 
 		 146 aa  52.8  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0606  DoxX family protein  42.45 
 
 		 143 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  33.58 
 
 		 148 aa  52.4  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  34.31 
 
 		 149 aa  52  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0591  DoxX family protein  48.78 
 
 		 147 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  34.88 
 
 		 139 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  39.09 
 
 		 137 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  34.59 
 
 		 164 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  35.61 
 
 		 145 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6025  DoxX family protein  37.5 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  35.61 
 
 		 145 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  38.97 
 
 		 173 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1441  DoxX family protein  40.82 
 
 		 140 aa  48.9  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0421253  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  34.85 
 
 		 145 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2743  DoxX family protein  34.45 
 
 		 177 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000157572  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  32.12 
 
 		 148 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  35.77 
 
 		 154 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  29.25 
 
 		 153 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  37.23 
 
 		 170 aa  46.2  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  37.21 
 
 		 198 aa  45.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  35.43 
 
 		 144 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  33.1 
 
 		 151 aa  46.2  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  32.37 
 
 		 137 aa  45.4  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  34.09 
 
 		 144 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  31.78 
 
 		 144 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  30.38 
 
 		 1888 aa  45.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2663  DoxX family protein  32.79 
 
 		 118 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0368307  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  36.57 
 
 		 149 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  32.33 
 
 		 149 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  36.45 
 
 		 147 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  34.78 
 
 		 130 aa  43.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  30.2 
 
 		 378 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  31.46 
 
 		 173 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  31.46 
 
 		 173 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  32.58 
 
 		 147 aa  42  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3233  DoxX family protein  31.03 
 
 		 405 aa  42  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  30.23 
 
 		 144 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  34.29 
 
 		 145 aa  42  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  35.56 
 
 		 173 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  30.3 
 
 		 127 aa  41.6  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  35.24 
 
 		 144 aa  42  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>