122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3346 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3346  DoxX family protein  100 
 
 		 206 aa  394  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5120  DoxX family protein  53.85 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1741  DoxX family protein  50.38 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100306 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3171  DoxX family protein  52.76 
 
 		 187 aa  99  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  47.79 
 
 		 180 aa  98.2  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4503  DoxX  51.49 
 
 		 197 aa  95.1  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  42.77 
 
 		 171 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  41.52 
 
 		 174 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1491  DoxX family protein  42.96 
 
 		 177 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  44.27 
 
 		 147 aa  88.2  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  43.55 
 
 		 144 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1493  DoxX  42.25 
 
 		 177 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1515  DoxX family protein  42.25 
 
 		 177 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  45.67 
 
 		 151 aa  87.4  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1048  DoxX  42.36 
 
 		 178 aa  86.3  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.083791  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  44.53 
 
 		 149 aa  85.9  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  44.17 
 
 		 144 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  52 
 
 		 147 aa  84.7  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  47.29 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  42.11 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  42.11 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2411  DoxX-like  43.31 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  45.45 
 
 		 173 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  41.73 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  41.09 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2062  DoxD-like family protein  40.62 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  48.09 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  41.04 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  44.7 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  41.73 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  41.73 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  44.7 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  44.7 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3911  DoxX family protein  47.92 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1057  DoxX family protein  38.24 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  36.23 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  36.23 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  36.23 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  45.6 
 
 		 144 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  34.78 
 
 		 149 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7013  DoxX family protein  47.76 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  48.85 
 
 		 150 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  44 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  35.51 
 
 		 147 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  37.98 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  36.92 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  36.92 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0412  DoxX family protein  49.62 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  35.51 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  38.76 
 
 		 148 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13020  hypothetical protein  37.5 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.923899  normal  0.136283 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  36.43 
 
 		 148 aa  73.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  35.97 
 
 		 148 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  36.15 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  36.76 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  38.64 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2277  DoxX family protein  46.88 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  normal  0.928998 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2257  DoxD-like family protein  40.16 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.418604  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2743  DoxX family protein  44.44 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000157572  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  39.85 
 
 		 159 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  35.92 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08840  predicted membrane protein  40.69 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.258983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  37.87 
 
 		 175 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  36.15 
 
 		 147 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4241  DoxX family protein  37.06 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  38.1 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  39.29 
 
 		 147 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  37.21 
 
 		 154 aa  64.3  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  37.06 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3842  DoxX family protein  47.22 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000608334  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3233  DoxX family protein  39.19 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6025  DoxX family protein  41.67 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5119  DoxX family protein  47.17 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000103447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5446  hypothetical protein  45.37 
 
 		 128 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5170  hypothetical protein  45.37 
 
 		 128 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000171714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5004  hypothetical protein  45.37 
 
 		 128 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.91746e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5020  hypothetical protein  45.37 
 
 		 128 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  41.13 
 
 		 146 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5564  hypothetical protein  45.37 
 
 		 128 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5499  hypothetical protein  45.37 
 
 		 128 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000803352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5412  hypothetical protein  45.37 
 
 		 128 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.745190000000001e-63 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0907  DoxX  49.43 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  37.41 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5443  hypothetical protein  45.28 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000785742  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5508  hypothetical protein  45.28 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000015109  unclonable  3.38736e-26 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4574  DoxX family protein  38.46 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0384  DoxX family protein  45.54 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  35.86 
 
 		 148 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  38.52 
 
 		 154 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2335  DoxX family protein  37.6 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  38.85 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  40.94 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  33.57 
 
 		 143 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  35.94 
 
 		 161 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  38.52 
 
 		 133 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0614  DoxD-like family  30.67 
 
 		 281 aa  52.4  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  40 
 
 		 153 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  36.84 
 
 		 148 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1539  DoxD family protein  30 
 
 		 281 aa  50.4  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.636212  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  38.4 
 
 		 153 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>