121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6025 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6025  DoxX family protein  100 
 
 		 283 aa  556  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08840  predicted membrane protein  41.21 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.258983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  33.9 
 
 		 296 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13020  hypothetical protein  44.17 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.923899  normal  0.136283 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  38.67 
 
 		 378 aa  112  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4241  DoxX family protein  34.31 
 
 		 297 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1493  DoxX  41.91 
 
 		 177 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1515  DoxX family protein  41.91 
 
 		 177 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3233  DoxX family protein  35.2 
 
 		 405 aa  90.5  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1491  DoxX family protein  41.98 
 
 		 177 aa  89  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  36.84 
 
 		 180 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4503  DoxX  43.8 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1884  DoxX family protein  35.22 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0388995  normal  0.30176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1904  DoxX  34.82 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.920346  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  37.7 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1950  DoxX family protein  34.82 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.992503  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  37.1 
 
 		 149 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  35 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  36.22 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  36.59 
 
 		 148 aa  71.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  35.77 
 
 		 148 aa  72  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  30.2 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5120  DoxX family protein  43.65 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  35.51 
 
 		 145 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  37.9 
 
 		 144 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  35.51 
 
 		 145 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7013  DoxX family protein  45.28 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  35.51 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  36.76 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  38.21 
 
 		 147 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  35.21 
 
 		 144 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  36.43 
 
 		 171 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  36.43 
 
 		 148 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  36.43 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  32.23 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3737  DoxX family protein  39.44 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  37.4 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  35.77 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  41.53 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  41.53 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  39.02 
 
 		 148 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  34.92 
 
 		 144 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  29.85 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2277  DoxX family protein  43.08 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  normal  0.928998 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  34.92 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  34.03 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  35.61 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  32.58 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  39.02 
 
 		 147 aa  58.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  37.98 
 
 		 173 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  39.02 
 
 		 147 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  39.02 
 
 		 147 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  37.98 
 
 		 173 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  37.98 
 
 		 173 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4065  DoxX  35.16 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4140  DoxX family protein  35.16 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.977135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  37.4 
 
 		 147 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  37.21 
 
 		 173 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  34.62 
 
 		 148 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  35.77 
 
 		 146 aa  57.4  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4294  DoxX family protein  35.16 
 
 		 181 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1057  DoxX family protein  35.94 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  38.21 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4574  DoxX family protein  33.74 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  36.89 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  37.4 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  37.4 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  36.43 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  37.4 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2743  DoxX family protein  33.62 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000157572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7103  membrane protein-like protein  36.92 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0284087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  36.59 
 
 		 147 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1775  DoxX family protein  31.01 
 
 		 152 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.019545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2062  DoxD-like family protein  33.09 
 
 		 144 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2411  DoxX-like  39.34 
 
 		 154 aa  54.3  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  36.22 
 
 		 134 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  35 
 
 		 145 aa  53.1  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  31.34 
 
 		 154 aa  52.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  30.66 
 
 		 164 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1048  DoxX  32 
 
 		 178 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.083791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5446  hypothetical protein  36.94 
 
 		 128 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5170  hypothetical protein  36.94 
 
 		 128 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000171714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5004  hypothetical protein  36.94 
 
 		 128 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.91746e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5020  hypothetical protein  36.94 
 
 		 128 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5564  hypothetical protein  36.94 
 
 		 128 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5499  hypothetical protein  36.94 
 
 		 128 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000803352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5412  hypothetical protein  36.94 
 
 		 128 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.745190000000001e-63 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3003  DoxX family protein  34.62 
 
 		 150 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015102 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5119  DoxX family protein  36.94 
 
 		 128 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000103447  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  31.06 
 
 		 167 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3842  DoxX family protein  36.94 
 
 		 128 aa  49.7  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000608334  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2257  DoxD-like family protein  33.09 
 
 		 144 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.418604  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  34.96 
 
 		 150 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  34.4 
 
 		 143 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1741  DoxX family protein  38.18 
 
 		 156 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100306 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5936  DoxX family protein  38.1 
 
 		 172 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  31.2 
 
 		 148 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5443  hypothetical protein  36.04 
 
 		 128 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000785742  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  33.33 
 
 		 149 aa  47  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5508  hypothetical protein  36.04 
 
 		 128 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000015109  unclonable  3.38736e-26 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>