79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4241 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4241  DoxX family protein  100 
 
 
297 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  84.8 
 
 
296 aa  477  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13020  hypothetical protein  57.3 
 
 
279 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.923899  normal  0.136283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1884  DoxX family protein  64.64 
 
 
277 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0388995  normal  0.30176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1950  DoxX family protein  64.29 
 
 
277 aa  269  5e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.992503  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1904  DoxX  64.29 
 
 
277 aa  269  5e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.920346  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3233  DoxX family protein  51.91 
 
 
405 aa  149  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  48.04 
 
 
378 aa  149  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08840  predicted membrane protein  38.67 
 
 
211 aa  90.1  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.258983  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6025  DoxX family protein  34.96 
 
 
283 aa  90.1  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1493  DoxX  37.86 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1515  DoxX family protein  37.86 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1491  DoxX family protein  37.14 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  34.56 
 
 
180 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4574  DoxX family protein  31.07 
 
 
198 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  32.31 
 
 
144 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  30.77 
 
 
144 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  35.11 
 
 
171 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1057  DoxX family protein  38.06 
 
 
176 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  35.88 
 
 
174 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  31.25 
 
 
149 aa  57  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  32.81 
 
 
149 aa  56.2  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  33.08 
 
 
144 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4503  DoxX  40 
 
 
197 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  30.43 
 
 
175 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  37.78 
 
 
173 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  37.78 
 
 
173 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  37.78 
 
 
173 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2743  DoxX family protein  32.61 
 
 
177 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000157572  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  29.63 
 
 
151 aa  53.9  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  36.84 
 
 
173 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  34.31 
 
 
140 aa  53.1  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2335  DoxX family protein  36.3 
 
 
141 aa  53.1  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7013  DoxX family protein  43.68 
 
 
198 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5120  DoxX family protein  33.59 
 
 
205 aa  52.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  29.92 
 
 
147 aa  52.8  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  27.01 
 
 
149 aa  52.8  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0412  DoxX family protein  40.25 
 
 
166 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  28.89 
 
 
154 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  30.23 
 
 
145 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  30.23 
 
 
145 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  30.23 
 
 
145 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  30 
 
 
144 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  29.01 
 
 
144 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1048  DoxX  33.08 
 
 
178 aa  50.4  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.083791  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  32.86 
 
 
185 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  28.35 
 
 
148 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  32.86 
 
 
185 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  34.27 
 
 
138 aa  48.1  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  36.72 
 
 
150 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  32.37 
 
 
138 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  32.31 
 
 
148 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  31.34 
 
 
146 aa  47.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  26.77 
 
 
148 aa  46.6  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  30.53 
 
 
154 aa  45.8  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5020  hypothetical protein  30.7 
 
 
128 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5004  hypothetical protein  30.7 
 
 
128 aa  45.8  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.91746e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5170  hypothetical protein  30.7 
 
 
128 aa  45.8  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000171714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5412  hypothetical protein  30.7 
 
 
128 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.745190000000001e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5499  hypothetical protein  30.7 
 
 
128 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000803352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5446  hypothetical protein  30.7 
 
 
128 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5564  hypothetical protein  30.7 
 
 
128 aa  45.8  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  34.35 
 
 
150 aa  45.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  38.37 
 
 
172 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  28.89 
 
 
154 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  32.28 
 
 
161 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3346  DoxX family protein  47.06 
 
 
206 aa  44.3  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  34.38 
 
 
147 aa  43.9  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3842  DoxX family protein  31.9 
 
 
128 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000608334  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  31.91 
 
 
146 aa  43.9  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  32.35 
 
 
131 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  32.82 
 
 
144 aa  43.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  32.82 
 
 
134 aa  43.5  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  37.97 
 
 
137 aa  43.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3171  DoxX family protein  39.01 
 
 
187 aa  43.1  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5443  hypothetical protein  28.95 
 
 
128 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000785742  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5119  DoxX family protein  28.95 
 
 
128 aa  42.7  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000103447  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5508  hypothetical protein  28.95 
 
 
128 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000015109  unclonable  3.38736e-26 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  31.06 
 
 
172 aa  42.4  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>