126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2743 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2743  DoxX family protein  100 
 
 
177 aa  341  4e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000157572  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  47.56 
 
 
175 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  43.03 
 
 
174 aa  125  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  39.64 
 
 
171 aa  121  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  45.51 
 
 
173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  44.85 
 
 
173 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  44.85 
 
 
173 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  44.85 
 
 
173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  37.88 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  38.84 
 
 
144 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  35.66 
 
 
149 aa  77  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  37.4 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  38.4 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  38.84 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  38.58 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  37.4 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13020  hypothetical protein  38.99 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.923899  normal  0.136283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  33.96 
 
 
296 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  39.39 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  33.58 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  41.6 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  38.35 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  43.65 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  37.12 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  37.12 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  35.43 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1057  DoxX family protein  35.92 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  38.35 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  36.36 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  36.36 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  41.35 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  35.61 
 
 
147 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  35.61 
 
 
147 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  36.8 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  35.04 
 
 
378 aa  65.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  36.29 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  37.1 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  37.1 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  33.33 
 
 
148 aa  63.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  37.1 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  37.9 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  32.58 
 
 
148 aa  63.2  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  35.16 
 
 
146 aa  63.2  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  34.96 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  34.68 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  37.1 
 
 
143 aa  61.6  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5446  hypothetical protein  35.19 
 
 
128 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5170  hypothetical protein  35.19 
 
 
128 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000171714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5004  hypothetical protein  35.19 
 
 
128 aa  59.7  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.91746e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5020  hypothetical protein  35.19 
 
 
128 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5564  hypothetical protein  35.19 
 
 
128 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5120  DoxX family protein  37.5 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4241  DoxX family protein  32.89 
 
 
297 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3842  DoxX family protein  36.36 
 
 
128 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000608334  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  34.88 
 
 
149 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  37.6 
 
 
141 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5499  hypothetical protein  35.19 
 
 
128 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000803352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5412  hypothetical protein  35.19 
 
 
128 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.745190000000001e-63 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1741  DoxX family protein  40.82 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100306 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  30.77 
 
 
154 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5119  DoxX family protein  35.19 
 
 
128 aa  58.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000103447  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  31.88 
 
 
149 aa  58.5  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3171  DoxX family protein  43.07 
 
 
187 aa  57.8  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4520  DoxX family protein  37.17 
 
 
146 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3003  DoxX family protein  37.6 
 
 
150 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015102 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1048  DoxX  36.03 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.083791  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  35.88 
 
 
239 aa  57  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2062  DoxD-like family protein  40.94 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4304  DoxX family protein  37.35 
 
 
167 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2411  DoxX-like  36.43 
 
 
154 aa  55.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  27.42 
 
 
144 aa  55.8  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5443  hypothetical protein  34.26 
 
 
128 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000785742  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5508  hypothetical protein  34.26 
 
 
128 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000015109  unclonable  3.38736e-26 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  55.5  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2257  DoxD-like family protein  43.9 
 
 
144 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.418604  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08840  predicted membrane protein  36.22 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.258983  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4282  DoxX family protein  41 
 
 
167 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  37.59 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3911  DoxX family protein  38.85 
 
 
189 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  32 
 
 
159 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  37.59 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  30.99 
 
 
154 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4151  DoxX  43 
 
 
167 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.839965  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2277  DoxX family protein  39.68 
 
 
146 aa  52.8  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  normal  0.928998 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1491  DoxX family protein  34.88 
 
 
177 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1493  DoxX  34.11 
 
 
177 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1515  DoxX family protein  34.11 
 
 
177 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4503  DoxX  36.92 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0412  DoxX family protein  35.51 
 
 
166 aa  49.3  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6025  DoxX family protein  35.42 
 
 
283 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3346  DoxX family protein  36.03 
 
 
206 aa  48.1  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  37.3 
 
 
144 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3262  DoxX family protein  39.17 
 
 
143 aa  47  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83259  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  34.78 
 
 
153 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  31.54 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  27.34 
 
 
198 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  32.31 
 
 
154 aa  47  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  30.95 
 
 
147 aa  45.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  29.13 
 
 
183 aa  45.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  29.92 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>