274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3881 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  100 
 
 
144 aa  272  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4107  DoxX family protein  81.54 
 
 
144 aa  166  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  49.65 
 
 
143 aa  107  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  47.86 
 
 
141 aa  106  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34190  predicted membrane protein  58.65 
 
 
167 aa  97.4  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  44.76 
 
 
239 aa  95.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  45.74 
 
 
148 aa  92  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  41.43 
 
 
149 aa  87.8  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  45.24 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  41.67 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  44.72 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0591  DoxX family protein  54.47 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  42.97 
 
 
144 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  40.48 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  38.46 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  42.22 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  36.99 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3003  DoxX family protein  36.76 
 
 
150 aa  77  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015102 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  37.33 
 
 
151 aa  77  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7264  membrane protein-like protein  51.59 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000149476  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  43.8 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  36.88 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  42.15 
 
 
171 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  38.46 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  33.55 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4520  DoxX family protein  39.42 
 
 
146 aa  73.6  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3262  DoxX family protein  40.62 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83259  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  38.22 
 
 
164 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  43.31 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  44.54 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  38.4 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  38.98 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  37.6 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  36.59 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  45.97 
 
 
147 aa  67  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  43.31 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  40.16 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  33.33 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  35.94 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  36.8 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  44.72 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  42.55 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  42.19 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  42.19 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  36.8 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  42.19 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  39.29 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  39.29 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  34.96 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  41.35 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  43.8 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  39.29 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  42.64 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  41.41 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  38.57 
 
 
147 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  36.09 
 
 
154 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  42.31 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  37.21 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  43.8 
 
 
173 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  43.8 
 
 
173 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  43.8 
 
 
173 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  35.61 
 
 
133 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02970  predicted quinol oxidase subunit  35.56 
 
 
130 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0600  DoxX family protein  35.56 
 
 
130 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0595  DoxX family protein  35.56 
 
 
130 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3289  putative inner membrane protein YqjF  35.56 
 
 
130 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02921  hypothetical protein  35.56 
 
 
130 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  34.11 
 
 
160 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  42.36 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3574  putative inner membrane protein YqjF  34.81 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  34.11 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.260448 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  34.31 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  38.76 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3260  putative inner membrane protein YqjF  34.81 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  37.78 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  37.61 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  33.83 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  38.76 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  41.94 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  35.61 
 
 
148 aa  57.4  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  32.28 
 
 
175 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  38.81 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2277  DoxX family protein  46.03 
 
 
146 aa  57  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  normal  0.928998 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  38.66 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  36.3 
 
 
161 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2062  DoxD-like family protein  40 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  37.8 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  37.32 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2743  DoxX family protein  37.61 
 
 
177 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000157572  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  36.3 
 
 
161 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  32.03 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  36.3 
 
 
161 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  36.3 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  35.77 
 
 
378 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  36.36 
 
 
133 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  36.36 
 
 
133 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4512  DoxX family protein  45.45 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.794637 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  34.35 
 
 
130 aa  53.9  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  32.23 
 
 
137 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  36.97 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>