170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4520 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4520  DoxX family protein  100 
 
 		 146 aa  280  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  47.79 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  45.22 
 
 		 239 aa  98.6  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3003  DoxX family protein  47.89 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  44.68 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7264  membrane protein-like protein  45.59 
 
 		 216 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000149476  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  34.07 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  39.42 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  35.77 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  38.28 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  35.51 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  29.32 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  36.23 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  29.32 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02435  predicted inner membrane protein  35.71 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1125  DoxX family protein  35.71 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2696  putative inner membrane protein YphA  35.71 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  33.06 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1134  DoxX family protein  35.71 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3262  DoxX family protein  41.51 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3775  putative inner membrane protein YphA  35.71 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02399  hypothetical protein  35.71 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2695  hypothetical protein  35.71 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2828  hypothetical protein  35.71 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  33.86 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  34.07 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  32.61 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  39.52 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  39.51 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  39.51 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2743  DoxX family protein  37.17 
 
 		 177 aa  57  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000157572  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  36.96 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  36.88 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  34.59 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1441  DoxX family protein  42.53 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0421253  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  37.4 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  40 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  35.66 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1096  DoxX family protein  36.63 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000704586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1118  DoxX family protein  36.63 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000073687  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  37.3 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0606  DoxX family protein  37.69 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  33.58 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  36.17 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  36.17 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  32.37 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  34.94 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  34.41 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  31.87 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  38.1 
 
 		 174 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  30.88 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7103  membrane protein-like protein  39.2 
 
 		 274 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0284087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  38.46 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4107  DoxX family protein  40.48 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  36.25 
 
 		 137 aa  50.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  34.85 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  34.85 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  34.85 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  36.96 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  34.09 
 
 		 164 aa  50.1  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  34.85 
 
 		 161 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2633  DoxX  30.25 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  30.95 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3260  putative inner membrane protein YqjF  32.81 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  30.95 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  30.95 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  33.33 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  31.5 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  32.06 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3589  putative inner membrane protein YqjF  41.67 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.24023 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2764  DoxX family protein  35.92 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3679  DoxX  34.75 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  32.06 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.260448 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3574  putative inner membrane protein YqjF  32.81 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  34.83 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02970  predicted quinol oxidase subunit  32.81 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0600  DoxX family protein  32.81 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02921  hypothetical protein  32.81 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  35.34 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0595  DoxX family protein  32.81 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  33.81 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  34.04 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  32.81 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0099  DoxX family protein  36.78 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00508391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  34.71 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3289  putative inner membrane protein YqjF  32.81 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  33.33 
 
 		 198 aa  48.1  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  32.61 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  26.76 
 
 		 183 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  33.33 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  37.08 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0591  DoxX family protein  40.34 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  30.71 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  35.38 
 
 		 183 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1932  DoxX family protein  33.33 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.486729 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  33.85 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3976  DoxX family protein  31.65 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603426  decreased coverage  0.00896237 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  34.43 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  30.53 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.453371 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>