96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2867 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  100 
 
 
378 aa  745    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3233  DoxX family protein  40.67 
 
 
405 aa  199  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  49.44 
 
 
296 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13020  hypothetical protein  42.79 
 
 
279 aa  149  8e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.923899  normal  0.136283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4241  DoxX family protein  48.04 
 
 
297 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6025  DoxX family protein  42.42 
 
 
283 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08840  predicted membrane protein  42.95 
 
 
211 aa  93.6  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.258983  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1950  DoxX family protein  41.2 
 
 
277 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.992503  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1904  DoxX  41.2 
 
 
277 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.920346  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1884  DoxX family protein  41.2 
 
 
277 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0388995  normal  0.30176 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  40.88 
 
 
144 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  41.48 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1515  DoxX family protein  39.58 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1493  DoxX  39.58 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  37.78 
 
 
144 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1491  DoxX family protein  38.89 
 
 
177 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  36.3 
 
 
144 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  41.18 
 
 
171 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  39.57 
 
 
151 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  39.42 
 
 
174 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  40.44 
 
 
149 aa  67  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  37.78 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  41.73 
 
 
173 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  38.24 
 
 
144 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  41.73 
 
 
173 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  41.73 
 
 
173 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  36.09 
 
 
149 aa  65.1  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  34.31 
 
 
180 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  37.76 
 
 
148 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  36.36 
 
 
148 aa  63.9  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  36.3 
 
 
145 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  36.3 
 
 
145 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  36.64 
 
 
147 aa  63.5  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  39.86 
 
 
173 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  35.61 
 
 
149 aa  62.8  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4574  DoxX family protein  32.22 
 
 
198 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  34.75 
 
 
154 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4503  DoxX  39.31 
 
 
197 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  42.86 
 
 
150 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2743  DoxX family protein  34.23 
 
 
177 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000157572  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  34.06 
 
 
148 aa  57.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  40.91 
 
 
147 aa  57.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  42.11 
 
 
150 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  33.57 
 
 
154 aa  55.5  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  34.29 
 
 
147 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1057  DoxX family protein  34.78 
 
 
176 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  31.62 
 
 
175 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7013  DoxX family protein  35.81 
 
 
198 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  35.61 
 
 
146 aa  53.5  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1775  DoxX family protein  30.15 
 
 
152 aa  53.5  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019545 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0907  DoxX  43.69 
 
 
135 aa  53.5  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  38.35 
 
 
149 aa  53.1  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  34.64 
 
 
148 aa  53.5  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0412  DoxX family protein  51.67 
 
 
166 aa  53.1  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  35.92 
 
 
182 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  36.62 
 
 
183 aa  53.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  34.75 
 
 
154 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  34.78 
 
 
161 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  34.81 
 
 
148 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  29.93 
 
 
149 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  30.67 
 
 
147 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  33.1 
 
 
146 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  38.06 
 
 
147 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  38.06 
 
 
147 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2062  DoxD-like family protein  36.76 
 
 
144 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  36.62 
 
 
183 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5120  DoxX family protein  36.36 
 
 
205 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  34.93 
 
 
131 aa  50.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  34.59 
 
 
153 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  37.31 
 
 
147 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3346  DoxX family protein  65.79 
 
 
206 aa  48.9  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  34.62 
 
 
153 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  35.07 
 
 
147 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  36.57 
 
 
147 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  36.57 
 
 
149 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  36.09 
 
 
147 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  30.6 
 
 
148 aa  47.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  35.07 
 
 
147 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  35.07 
 
 
147 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  32.85 
 
 
138 aa  47.8  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  35.07 
 
 
147 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2277  DoxX family protein  50 
 
 
146 aa  47  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  normal  0.928998 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  33.8 
 
 
188 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2257  DoxD-like family protein  51.28 
 
 
144 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.418604  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1048  DoxX  30.15 
 
 
178 aa  46.6  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.083791  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  33.33 
 
 
153 aa  46.2  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4065  DoxX  28.5 
 
 
181 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4140  DoxX family protein  28.5 
 
 
181 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.977135  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  30.15 
 
 
145 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  30.07 
 
 
136 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  30 
 
 
137 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  33.09 
 
 
172 aa  43.9  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  31.91 
 
 
144 aa  43.5  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  31.69 
 
 
153 aa  43.5  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4294  DoxX family protein  29.38 
 
 
181 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322086  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0576  DoxX family protein  31.82 
 
 
143 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468844  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>