191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2411 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2411  DoxX-like  100 
 
 
154 aa  301  3.0000000000000004e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  50.36 
 
 
147 aa  137  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  54.84 
 
 
149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  50 
 
 
151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  49.28 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  47.1 
 
 
144 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  46.88 
 
 
149 aa  121  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  49.22 
 
 
148 aa  121  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  47.59 
 
 
149 aa  120  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  48.44 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  46.56 
 
 
144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  50.75 
 
 
146 aa  111  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  48.28 
 
 
145 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  53.38 
 
 
150 aa  110  7.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  48.28 
 
 
145 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  58.02 
 
 
150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  48.28 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  57.26 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2277  DoxX family protein  56.3 
 
 
146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  normal  0.928998 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  43.48 
 
 
144 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  49.64 
 
 
147 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  54.4 
 
 
149 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  50.39 
 
 
144 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  46.31 
 
 
147 aa  103  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  46.31 
 
 
147 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  46.31 
 
 
147 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  46.92 
 
 
149 aa  101  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  48.34 
 
 
148 aa  100  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  52.42 
 
 
147 aa  100  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  45.65 
 
 
154 aa  97.8  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  44.2 
 
 
148 aa  97.1  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  45.58 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  45.58 
 
 
147 aa  95.5  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  45.58 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  45.27 
 
 
147 aa  94.7  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  44.9 
 
 
147 aa  93.6  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2062  DoxD-like family protein  48.82 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  49.21 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  49.21 
 
 
153 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  46.26 
 
 
154 aa  87  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  44.27 
 
 
146 aa  86.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  42.97 
 
 
149 aa  85.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  40.94 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2257  DoxD-like family protein  50.41 
 
 
144 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.418604  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4503  DoxX  52.71 
 
 
197 aa  83.6  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  40.82 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1775  DoxX family protein  42.19 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019545 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  44.36 
 
 
145 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1057  DoxX family protein  47.29 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  48.41 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5120  DoxX family protein  40.94 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  41.54 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1491  DoxX family protein  35.9 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0907  DoxX  49.58 
 
 
135 aa  72  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1048  DoxX  39.1 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.083791  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1493  DoxX  35.9 
 
 
177 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1515  DoxX family protein  35.9 
 
 
177 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0412  DoxX family protein  55.34 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  40.6 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  40 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2335  DoxX family protein  41.86 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7013  DoxX family protein  51.22 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1539  DoxD family protein  34.51 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.636212  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  38.22 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  35.97 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  38.4 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3466  DoxX family protein  31.21 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0614  DoxD-like family  34.51 
 
 
281 aa  64.3  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3346  DoxX family protein  44.09 
 
 
206 aa  63.9  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0883  DoxX family protein  39.46 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  40 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  39.2 
 
 
173 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5119  DoxX family protein  45.54 
 
 
128 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000103447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3842  DoxX family protein  43.24 
 
 
128 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000608334  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  40.68 
 
 
170 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2743  DoxX family protein  35.77 
 
 
177 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000157572  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  42.11 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  34.38 
 
 
175 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2401  hypothetical protein  33.63 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5446  hypothetical protein  44.55 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5170  hypothetical protein  44.55 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000171714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5004  hypothetical protein  44.55 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.91746e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5020  hypothetical protein  44.55 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381098  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5412  hypothetical protein  44.55 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.745190000000001e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5564  hypothetical protein  44.55 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  34.78 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5499  hypothetical protein  44.55 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000803352  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1741  DoxX family protein  42.57 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100306 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  34.33 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  32.58 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6025  DoxX family protein  40.54 
 
 
283 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  39.84 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  36.91 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5776  DoxX family membrane protein  41.91 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1834  DoxX  40.44 
 
 
137 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  38.4 
 
 
173 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2445  DoxX family protein  40.44 
 
 
137 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  38.4 
 
 
173 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  38.4 
 
 
173 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5443  hypothetical protein  42.57 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000785742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>