172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0190 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  100 
 
 		 145 aa  283  5.999999999999999e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  85.52 
 
 		 145 aa  233  7e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  70.5 
 
 		 148 aa  189  8e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0883  DoxX family protein  64.03 
 
 		 147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  49.65 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  46.38 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  46.38 
 
 		 154 aa  110  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  40 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  41.48 
 
 		 154 aa  97.1  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  41.55 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  42.36 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  43.28 
 
 		 147 aa  93.6  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  41.67 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  46.97 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  45.26 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  45.26 
 
 		 153 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  40.44 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  39.16 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  47.45 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  44.6 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  38.13 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  41.41 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  40.29 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  43.08 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  42.45 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  39.16 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  42.45 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  42.45 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  42.45 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  38.26 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  42.45 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  42.42 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  42.45 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  42.45 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  38.26 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  42.45 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  38.26 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  41.01 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1775  DoxX family protein  31.34 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.019545 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  43.18 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  41.67 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2411  DoxX-like  42.11 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  41.79 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  39.42 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  40 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  41.04 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2062  DoxD-like family protein  43.18 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  41.04 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  39.55 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  37.78 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2277  DoxX family protein  45.19 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  normal  0.928998 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  31.88 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  35.51 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  35.77 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1057  DoxX family protein  37.59 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  37.59 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  32.09 
 
 		 180 aa  57.4  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2257  DoxD-like family protein  43.94 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.418604  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  36.64 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  34.88 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  36.63 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  28.47 
 
 		 378 aa  54.3  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  35.04 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  33.79 
 
 		 172 aa  52  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4503  DoxX  36.91 
 
 		 197 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  36.08 
 
 		 196 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  31.82 
 
 		 175 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  34.78 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  32.58 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  28.19 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  28.19 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.260448 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  30.71 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  31.62 
 
 		 161 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  31.62 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  31.62 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  31.62 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0510711 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02970  predicted quinol oxidase subunit  28.57 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0600  DoxX family protein  28.57 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3233  DoxX family protein  35.34 
 
 		 405 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  34.78 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02921  hypothetical protein  28.57 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  34.78 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  34.78 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  30.88 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0595  DoxX family protein  28.57 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3289  putative inner membrane protein YqjF  28.57 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  31.06 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  30.15 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  30.43 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  31.34 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3260  putative inner membrane protein YqjF  27.86 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0412  DoxX family protein  38.46 
 
 		 166 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3574  putative inner membrane protein YqjF  27.86 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1115  hypothetical protein  30.83 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.192831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0544  DoxX family protein  30.83 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5119  DoxX family protein  37.17 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000103447  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0480  DoxX family protein  30.83 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111786  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1491  DoxX family protein  35.65 
 
 		 177 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  30.43 
 
 		 183 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1515  DoxX family protein  35.65 
 
 		 177 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>