120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6484 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  100 
 
 		 175 aa  343  7e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  49.43 
 
 		 174 aa  160  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  49.11 
 
 		 171 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2743  DoxX family protein  49.01 
 
 		 177 aa  135  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000157572  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  49.14 
 
 		 173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  49.14 
 
 		 173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  49.14 
 
 		 173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  44 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  40 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  40.65 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  39.84 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  42.34 
 
 		 150 aa  77  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  35.51 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  35.82 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  36.57 
 
 		 149 aa  73.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  35.82 
 
 		 149 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  35.66 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  38.57 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  37.3 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  35.61 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3842  DoxX family protein  43.33 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000608334  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  34.33 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5446  hypothetical protein  39.47 
 
 		 128 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5170  hypothetical protein  39.47 
 
 		 128 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000171714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5004  hypothetical protein  39.47 
 
 		 128 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.91746e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5020  hypothetical protein  39.47 
 
 		 128 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5564  hypothetical protein  39.47 
 
 		 128 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5499  hypothetical protein  39.47 
 
 		 128 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000803352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5412  hypothetical protein  39.47 
 
 		 128 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.745190000000001e-63 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  39.06 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  37.3 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5119  DoxX family protein  39.47 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000103447  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  36.51 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  37.01 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5443  hypothetical protein  39.47 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000785742  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1057  DoxX family protein  34.67 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  37.3 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5508  hypothetical protein  39.47 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000015109  unclonable  3.38736e-26 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5120  DoxX family protein  36.96 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  31.91 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  36.51 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  34.72 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  34.88 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  35.82 
 
 		 147 aa  62  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  38.1 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  35.61 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  34.09 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  34.09 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  34.09 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  34.85 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  34.85 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  32.56 
 
 		 148 aa  60.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  36.09 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  33.33 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1539  DoxD family protein  29.93 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.636212  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0614  DoxD-like family  29.2 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2062  DoxD-like family protein  39.37 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  34.71 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  34.09 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2257  DoxD-like family protein  39.68 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.418604  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  31.91 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  37.5 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  31.43 
 
 		 378 aa  54.7  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1048  DoxX  34.42 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.083791  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  32.35 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1741  DoxX family protein  34.48 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100306 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  31.82 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  32.65 
 
 		 146 aa  52.4  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  35.71 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  30.57 
 
 		 296 aa  52  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4241  DoxX family protein  30.43 
 
 		 297 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  30.66 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2411  DoxX-like  34.38 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0907  DoxX  39.5 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4541  DoxX family protein  38.1 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0910404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  34.07 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13020  hypothetical protein  29.94 
 
 		 279 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.923899  normal  0.136283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1775  DoxX family protein  29.17 
 
 		 152 aa  48.9  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.019545 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  33.87 
 
 		 147 aa  48.1  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3322  DoxX  32.52 
 
 		 180 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3384  DoxX family protein  32.52 
 
 		 180 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0241193  normal  0.0518004 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3333  DoxX family protein  32.52 
 
 		 180 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671485  normal  0.176308 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2277  DoxX family protein  34.88 
 
 		 146 aa  48.1  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  normal  0.928998 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  47.4  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  32.59 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3841  DoxX family protein  31.97 
 
 		 136 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  33.94 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4427  DoxX family protein  36.19 
 
 		 131 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  34.4 
 
 		 133 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  31.82 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0412  DoxX family protein  30.99 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3003  DoxX family protein  32.26 
 
 		 150 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015102 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  32.56 
 
 		 154 aa  45.8  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6025  DoxX family protein  31.9 
 
 		 283 aa  45.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  32.26 
 
 		 148 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  27.41 
 
 		 139 aa  45.1  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  32.28 
 
 		 144 aa  44.7  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  34.68 
 
 		 137 aa  45.1  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1491  DoxX family protein  29.1 
 
 		 177 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>