106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0883 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0883  DoxX family protein  100 
 
 
147 aa  289  7e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  72.11 
 
 
148 aa  226  7e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  65 
 
 
145 aa  165  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  64.03 
 
 
145 aa  152  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  44.62 
 
 
154 aa  110  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  40.82 
 
 
146 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  41.55 
 
 
149 aa  102  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  43.85 
 
 
154 aa  97.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  41.13 
 
 
151 aa  93.6  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  39.44 
 
 
147 aa  88.6  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  39.23 
 
 
154 aa  87.8  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1775  DoxX family protein  35.94 
 
 
152 aa  85.9  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019545 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  42.96 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  42.34 
 
 
153 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  40 
 
 
149 aa  84  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  38.35 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  41.09 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  37.78 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  38.06 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  41.13 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  36.3 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  38.35 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  42.45 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  40.29 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  37.59 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  39.55 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  40.74 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  40.74 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  37.41 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  37.41 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  40.74 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  37.41 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  40.3 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  38.97 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  37.23 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  39.26 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  39.26 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  39.26 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2411  DoxX-like  39.46 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  39.13 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  33.09 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  40.15 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  38.69 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  38.52 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  38.69 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1057  DoxX family protein  35.61 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  40.3 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2277  DoxX family protein  42.22 
 
 
146 aa  62.8  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  normal  0.928998 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  40.6 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  37.98 
 
 
147 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  35.07 
 
 
171 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2062  DoxD-like family protein  41.04 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  39.39 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  31.06 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  34.33 
 
 
174 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  37.88 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  34.59 
 
 
173 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  30.94 
 
 
133 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  32.09 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  34.59 
 
 
173 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  34.59 
 
 
173 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  34.59 
 
 
173 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  32.87 
 
 
164 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  30.53 
 
 
180 aa  50.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  40.62 
 
 
216 aa  49.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2257  DoxD-like family protein  42.54 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.418604  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4503  DoxX  38.06 
 
 
197 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1491  DoxX family protein  37.72 
 
 
177 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  32.58 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  30.83 
 
 
175 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  33.59 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1493  DoxX  37.5 
 
 
177 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1515  DoxX family protein  37.5 
 
 
177 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3466  DoxX family protein  30.22 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0907  DoxX  40 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  30.69 
 
 
196 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  33.67 
 
 
197 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  35.42 
 
 
202 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  35.42 
 
 
197 aa  43.9  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  31 
 
 
196 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5120  DoxX family protein  37.4 
 
 
205 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0412  DoxX family protein  38.32 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3233  DoxX family protein  31.16 
 
 
405 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  29.33 
 
 
378 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  31.47 
 
 
172 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  30.23 
 
 
140 aa  42  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  28.68 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  29.55 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7013  DoxX family protein  48.89 
 
 
198 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  29.63 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3702  DoxX family protein  29.1 
 
 
134 aa  42  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.955639 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  33.33 
 
 
198 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  30.77 
 
 
153 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0556  DoxX family protein  29.25 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2995  DoxX family protein  28.48 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00203576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5119  DoxX family protein  33.33 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000103447  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  28.47 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5170  hypothetical protein  32.48 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000171714  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5020  hypothetical protein  32.48 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5564  hypothetical protein  32.48 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000197435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>