83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1775 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1775  DoxX family protein  100 
 
 		 152 aa  301  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.019545 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  47.97 
 
 		 154 aa  141  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  44.52 
 
 		 146 aa  136  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  43.92 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  48.98 
 
 		 154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  41.38 
 
 		 153 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  41.38 
 
 		 153 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  38.46 
 
 		 154 aa  100  5e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  40.69 
 
 		 153 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  34.29 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  32.88 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  32.59 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0883  DoxX family protein  35.94 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2411  DoxX-like  42.19 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  34.51 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  28.38 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  35.53 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  33.85 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  33.56 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  31.13 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  33.1 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  31.29 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  28.37 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  33.33 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  28.77 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  32.33 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  31.13 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  32.33 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  32.33 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  28.08 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  31.34 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  28.38 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  30.82 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  31.13 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2062  DoxD-like family protein  34.93 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  31.37 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  30.97 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  30.97 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  32.26 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  34.64 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  30.32 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  31.76 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  30.43 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2277  DoxX family protein  33.57 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  normal  0.928998 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  30.15 
 
 		 378 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  29.68 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  29.68 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  25.55 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  29.68 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  31.51 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  29.68 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  30.82 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  30.08 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  27.54 
 
 		 296 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  29.17 
 
 		 175 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  28.36 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2257  DoxD-like family protein  34.25 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.418604  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1057  DoxX family protein  34.38 
 
 		 176 aa  47.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  34.09 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  30.41 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4541  DoxX family protein  35.21 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0910404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  30.26 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  27.41 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13020  hypothetical protein  28.37 
 
 		 279 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.923899  normal  0.136283 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0907  DoxX  40.87 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  27.82 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  34.44 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6025  DoxX family protein  30.25 
 
 		 283 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  32.84 
 
 		 147 aa  44.3  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  28.15 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  27.41 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  30.6 
 
 		 136 aa  42.4  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  25.5 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  26.76 
 
 		 239 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  26.95 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4427  DoxX family protein  33.8 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  30.2 
 
 		 160 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  30.2 
 
 		 160 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.260448 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  28.86 
 
 		 161 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  28.86 
 
 		 161 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6128  hypothetical protein  36.62 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.134606 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  28.86 
 
 		 161 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  28.86 
 
 		 161 aa  40.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>