94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2335 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2335  DoxX family protein  100 
 
 
141 aa  256  6e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2411  DoxX-like  42.19 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  42.75 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5120  DoxX family protein  36.8 
 
 
205 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  35.07 
 
 
296 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13020  hypothetical protein  35.82 
 
 
279 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.923899  normal  0.136283 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  36.15 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  42.64 
 
 
150 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  34.88 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  34.11 
 
 
147 aa  57.4  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  34.65 
 
 
144 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  37.93 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  36.3 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  34.07 
 
 
149 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  31.54 
 
 
154 aa  53.5  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  35.25 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  34.92 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  32.56 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2401  hypothetical protein  34.65 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1057  DoxX family protein  38.58 
 
 
176 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  31.65 
 
 
378 aa  50.4  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  40 
 
 
147 aa  50.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  38.89 
 
 
137 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  32.84 
 
 
154 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  34.59 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1491  DoxX family protein  32.31 
 
 
177 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1539  DoxD family protein  31.34 
 
 
281 aa  48.9  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.636212  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  33.33 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1775  DoxX family protein  30 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019545 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  34.33 
 
 
148 aa  47.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  39.53 
 
 
149 aa  47.8  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  32.03 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  34.88 
 
 
180 aa  47  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  31.54 
 
 
148 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1515  DoxX family protein  31.54 
 
 
177 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4241  DoxX family protein  35.82 
 
 
297 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1493  DoxX  31.54 
 
 
177 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0614  DoxD-like family  30.6 
 
 
281 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  31.21 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  33.33 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  31.62 
 
 
154 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  27.27 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3233  DoxX family protein  35.82 
 
 
405 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0412  DoxX family protein  59.09 
 
 
166 aa  45.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  35.11 
 
 
145 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  34.35 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  31.54 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  34.35 
 
 
147 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  33.63 
 
 
127 aa  44.3  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  32.35 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  30.97 
 
 
129 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  34.35 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  35.25 
 
 
153 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  30.3 
 
 
143 aa  43.9  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  31 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  35.25 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  40 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0512  DoxX family protein  37.86 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08840  predicted membrane protein  33.58 
 
 
211 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.258983  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  29.41 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6128  hypothetical protein  37.93 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.134606 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  31.15 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  33.59 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  35.66 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3346  DoxX family protein  34.4 
 
 
206 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  36.45 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  33.05 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  35.43 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34190  predicted membrane protein  37.4 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  27.88 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  32.35 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  40 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  27.88 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  40 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  40 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3171  DoxX family protein  38.35 
 
 
187 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  29.46 
 
 
182 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  34.51 
 
 
170 aa  41.6  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  30.23 
 
 
183 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0467  DoxX family protein  36.89 
 
 
137 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123633  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  32.31 
 
 
148 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1834  DoxX  37.59 
 
 
137 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  28.46 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  30.23 
 
 
188 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2445  DoxX family protein  37.59 
 
 
137 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0839  DoxX family protein  29.13 
 
 
144 aa  41.2  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.496413 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  33.86 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3623  DoxX family protein  33.33 
 
 
174 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.0330424 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2450  DoxX family protein  37.59 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0306678  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  34.44 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  34.13 
 
 
146 aa  41.2  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  32.06 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  29.46 
 
 
183 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6025  DoxX family protein  30.63 
 
 
283 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>