40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2401 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2401  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  312  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4714  DoxX family protein  41.41 
 
 		 148 aa  94  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6128  hypothetical protein  41.38 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.134606 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  35.64 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3466  DoxX family protein  34.96 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0614  DoxD-like family  36.36 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1539  DoxD family protein  35.83 
 
 		 281 aa  54.7  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.636212  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  36 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  36 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  36 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  34.38 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  36 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  33.33 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  42.53 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  33.06 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  35 
 
 		 171 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  31.93 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  35 
 
 		 174 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4427  DoxX family protein  39.53 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  35 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  37.72 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  37.29 
 
 		 146 aa  48.5  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  35 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  30.25 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  35 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  33.58 
 
 		 170 aa  48.1  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  37.93 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2411  DoxX-like  33.63 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  33.33 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  28.89 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0431  DoxX family protein  33.04 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  36.52 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4059  DoxX family protein  37.21 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  31.96 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2335  DoxX family protein  33.86 
 
 		 141 aa  42  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1006  DoxX family protein  40.74 
 
 		 138 aa  41.2  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4541  DoxX family protein  34.88 
 
 		 131 aa  41.2  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0910404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  32.76 
 
 		 154 aa  41.2  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  26.89 
 
 		 149 aa  40.8  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  31.33 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>