172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4623 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  100 
 
 
139 aa  280  6.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  36.36 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3003  DoxX family protein  39.84 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  36.69 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  34.75 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  35.71 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  36.29 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  39.84 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  35.66 
 
 
134 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  36.29 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  32.21 
 
 
154 aa  62  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  35.34 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  33.33 
 
 
148 aa  61.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  29.55 
 
 
148 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  33.33 
 
 
133 aa  60.8  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  33.9 
 
 
133 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  35.07 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  35.04 
 
 
133 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  31.94 
 
 
164 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  35.61 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  36.59 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  37.9 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  37.01 
 
 
144 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  31.16 
 
 
145 aa  58.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  34.45 
 
 
133 aa  57.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  28.79 
 
 
181 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  34.45 
 
 
133 aa  57  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3679  DoxX  32 
 
 
162 aa  57  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244445  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  35.34 
 
 
153 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  31.65 
 
 
138 aa  56.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  36.64 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0591  DoxX family protein  39.39 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  32.82 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0883  DoxX family protein  30.6 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1775  DoxX family protein  30.43 
 
 
152 aa  54.3  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  34.62 
 
 
144 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4520  DoxX family protein  36.07 
 
 
146 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  42.65 
 
 
127 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  36.15 
 
 
153 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  34.27 
 
 
145 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  36.36 
 
 
144 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  30.58 
 
 
137 aa  52.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  31.75 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  35.43 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  32.58 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  31.4 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  36.92 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  35.43 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  34.88 
 
 
239 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0701  DoxX family protein  31.93 
 
 
128 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0431  DoxX family protein  32.31 
 
 
136 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  32.58 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  32.81 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  35.77 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  39.36 
 
 
170 aa  50.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3262  DoxX family protein  37.1 
 
 
143 aa  50.8  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83259  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  33.33 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  29.27 
 
 
183 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  29.27 
 
 
188 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  29.27 
 
 
183 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1425  DoxX family protein  27.14 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.305544  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  33.33 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  28.46 
 
 
182 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  31.58 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  26.36 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2898  DoxX  30.34 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  34.74 
 
 
216 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2048  DoxX family protein  26.77 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000018933  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6128  hypothetical protein  36.84 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.134606 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  34.13 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  29.75 
 
 
145 aa  47.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  42.47 
 
 
136 aa  47.8  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  31.36 
 
 
130 aa  47  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1372  DoxX family protein  33.94 
 
 
152 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4107  DoxX family protein  35.71 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2995  DoxX family protein  28.57 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00203576  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  36.14 
 
 
198 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  27.41 
 
 
175 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  27.87 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  32.89 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  25.56 
 
 
161 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  35.37 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  26.47 
 
 
160 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  26.47 
 
 
160 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.260448 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  32.81 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  29.92 
 
 
171 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  32.23 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  25.56 
 
 
161 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  30 
 
 
172 aa  44.3  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  28.1 
 
 
137 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  25.56 
 
 
161 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2411  DoxX-like  32.58 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  34.94 
 
 
204 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  34.12 
 
 
198 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3737  DoxX family protein  32.53 
 
 
168 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02970  predicted quinol oxidase subunit  26.15 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02921  hypothetical protein  26.15 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2014  DoxX family protein  32.14 
 
 
179 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0595  DoxX family protein  26.15 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  25.56 
 
 
161 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>