256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2313 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  100 
 
 		 145 aa  276  6e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  98.62 
 
 		 145 aa  274  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  98.62 
 
 		 145 aa  274  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  91.72 
 
 		 144 aa  232  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  67.59 
 
 		 151 aa  198  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  68.31 
 
 		 144 aa  193  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  65.73 
 
 		 144 aa  191  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  66.21 
 
 		 148 aa  191  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  66.67 
 
 		 149 aa  186  9e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  62.07 
 
 		 148 aa  184  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  62.94 
 
 		 144 aa  183  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  61.54 
 
 		 144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  63.89 
 
 		 149 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  63.31 
 
 		 149 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  61.11 
 
 		 147 aa  179  9.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2062  DoxD-like family protein  69.93 
 
 		 144 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  64.34 
 
 		 146 aa  174  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  70.97 
 
 		 147 aa  168  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  64.83 
 
 		 147 aa  168  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  70.97 
 
 		 147 aa  168  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  70.97 
 
 		 147 aa  168  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  70.16 
 
 		 147 aa  167  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  64.83 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  69.6 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  69.6 
 
 		 147 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  69.6 
 
 		 147 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2257  DoxD-like family protein  68.53 
 
 		 144 aa  160  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.418604  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  68.8 
 
 		 147 aa  159  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  57.93 
 
 		 149 aa  159  9e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  63.57 
 
 		 147 aa  156  7e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  64.18 
 
 		 148 aa  154  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  65.91 
 
 		 147 aa  151  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  61.9 
 
 		 149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2277  DoxX family protein  62.94 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  normal  0.928998 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  55.17 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  53.79 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2411  DoxX-like  48.28 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  41.1 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  45.52 
 
 		 148 aa  97.4  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  40.85 
 
 		 154 aa  96.7  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  37.14 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  39.34 
 
 		 180 aa  88.2  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3842  DoxX family protein  48.65 
 
 		 128 aa  86.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000608334  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  40 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  37.12 
 
 		 171 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5446  hypothetical protein  48.65 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5119  DoxX family protein  48.65 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000103447  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5170  hypothetical protein  48.65 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000171714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5004  hypothetical protein  48.65 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.91746e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5020  hypothetical protein  48.65 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381098  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5499  hypothetical protein  48.65 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000803352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5564  hypothetical protein  48.65 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1057  DoxX family protein  40.94 
 
 		 176 aa  84.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5412  hypothetical protein  48.65 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.745190000000001e-63 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5508  hypothetical protein  49.55 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000015109  unclonable  3.38736e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5443  hypothetical protein  49.55 
 
 		 128 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000785742  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  37.9 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  39.04 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0907  DoxX  51.33 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0412  DoxX family protein  46.4 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  43.8 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2663  DoxX family protein  63.33 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0368307  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  43.31 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1048  DoxX  39.84 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.083791  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  37.98 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  40.15 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  40.65 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  40.83 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4503  DoxX  44.19 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  37.1 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  37.1 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  33.57 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  37.1 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  36.51 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  40.16 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  36.76 
 
 		 378 aa  70.1  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5120  DoxX family protein  39.53 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1493  DoxX  37.5 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1515  DoxX family protein  37.5 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1491  DoxX family protein  37.5 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1775  DoxX family protein  32.33 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.019545 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  40 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3911  DoxX family protein  42.24 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  37.1 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  34.68 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2743  DoxX family protein  37.07 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000157572  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  35.43 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  40.15 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  37.5 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  33.57 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  35.64 
 
 		 144 aa  62  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0883  DoxX family protein  37.41 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  34.35 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  35.51 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13020  hypothetical protein  32.81 
 
 		 279 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.923899  normal  0.136283 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  37.5 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6025  DoxX family protein  38.94 
 
 		 283 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  29.46 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  35.16 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3466  DoxX family protein  34.11 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>