154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6351 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  100 
 
 		 141 aa  271  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  48.18 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  45 
 
 		 239 aa  100  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4520  DoxX family protein  48 
 
 		 146 aa  99.4  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3003  DoxX family protein  44.44 
 
 		 150 aa  97.4  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015102 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  47.86 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3262  DoxX family protein  44.37 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83259  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7264  membrane protein-like protein  48.09 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000149476  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4107  DoxX family protein  45.31 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  35.51 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  37.23 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  43.08 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  40 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1441  DoxX family protein  46.39 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0421253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7103  membrane protein-like protein  40.15 
 
 		 274 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0284087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  40.34 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  39.84 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  39.2 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0606  DoxX family protein  42.86 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  34.04 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  36.89 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  36.89 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0591  DoxX family protein  41.67 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  34.62 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  36.92 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  36.07 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  32.19 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  36.17 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  36.07 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5120  DoxX family protein  39.53 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  37.24 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  32.88 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  32.59 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  33.59 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  35.34 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  37.1 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34190  predicted membrane protein  43.55 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  38.93 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2743  DoxX family protein  38.05 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000157572  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  39.23 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  36.92 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  37.5 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  34.68 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  35.64 
 
 		 137 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  35.29 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  34.09 
 
 		 147 aa  52.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  32.82 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  33.59 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  35.64 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  36.22 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  35.66 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  33.61 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  35.43 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  35.59 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  38.3 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  33.33 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  33 
 
 		 216 aa  50.8  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  33.58 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  37.78 
 
 		 137 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  37.78 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  34.92 
 
 		 149 aa  50.1  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  37.65 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  35.58 
 
 		 197 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  38.04 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  33.82 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  34.62 
 
 		 197 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  32.8 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  29.85 
 
 		 198 aa  48.9  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  32.8 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1556  DoxX family protein  40.74 
 
 		 199 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  38.04 
 
 		 196 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  31.58 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  31.16 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  33.66 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  33.66 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  33.05 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  33.66 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  32.8 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  33.6 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  33.6 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  32 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  31.71 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  30.59 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  30.77 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  27.89 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  33.6 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  30.59 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  33.6 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  32.06 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  30.71 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  31.37 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  34.29 
 
 		 202 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  35.79 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  34.29 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  30.4 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  31.33 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3346  DoxX family protein  33.78 
 
 		 206 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  32.79 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  30.3 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  35.96 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>