164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6404 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6404  DoxX  100 
 
 
143 aa  268  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  47.76 
 
 
141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3003  DoxX family protein  50.36 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015102 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  49.65 
 
 
144 aa  108  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0591  DoxX family protein  57.5 
 
 
147 aa  103  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  43.84 
 
 
239 aa  102  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4520  DoxX family protein  45.97 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  42.15 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4107  DoxX family protein  50.79 
 
 
144 aa  80.1  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0606  DoxX family protein  48.72 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34190  predicted membrane protein  47.24 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3262  DoxX family protein  38.1 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83259  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  40 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7264  membrane protein-like protein  46.51 
 
 
216 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000149476  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  40.32 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  36.69 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  36 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  37.01 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  36.09 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  36 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  35.43 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  34.68 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  34.68 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  33.33 
 
 
147 aa  67  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  33.87 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  35.48 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  32.12 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1441  DoxX family protein  39.26 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0421253  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  37.01 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  33.87 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  36.07 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  33.06 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  35.2 
 
 
171 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  38.4 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  36.76 
 
 
146 aa  62  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  34.35 
 
 
147 aa  60.5  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  35.56 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  31.54 
 
 
164 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  35.11 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  36.36 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  36.36 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  36.36 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  36.8 
 
 
147 aa  58.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  33.8 
 
 
164 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  36.36 
 
 
147 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  36.36 
 
 
147 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  34.4 
 
 
174 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  36.75 
 
 
152 aa  58.2  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  36.36 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  35.61 
 
 
147 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  33.33 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  36.67 
 
 
144 aa  57  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  34.92 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  32.85 
 
 
150 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  32.86 
 
 
148 aa  54.7  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  36.21 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  37.23 
 
 
149 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  34.4 
 
 
149 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  34.59 
 
 
149 aa  52.8  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2743  DoxX family protein  34.82 
 
 
177 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000157572  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2663  DoxX family protein  46.43 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0368307  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  33.33 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  34.69 
 
 
153 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  30.77 
 
 
136 aa  51.6  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2014  DoxX family protein  30.77 
 
 
179 aa  51.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4541  DoxX family protein  46.51 
 
 
131 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0910404  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  33.33 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  31.21 
 
 
198 aa  51.6  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  33.33 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  31.25 
 
 
150 aa  50.8  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1006  DoxX family protein  38.24 
 
 
138 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1096  DoxX family protein  35.96 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000704586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1118  DoxX family protein  35.96 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000073687  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  35.14 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  33.05 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4512  DoxX family protein  40.94 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.794637 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0907  DoxX  45.05 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4427  DoxX family protein  45.35 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  33.09 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  31.85 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7103  membrane protein-like protein  28.68 
 
 
274 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0284087  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  35.88 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1775  DoxX family protein  29.63 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  33.6 
 
 
173 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  35.2 
 
 
173 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  35.2 
 
 
173 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  35.2 
 
 
173 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  29.37 
 
 
154 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  32.8 
 
 
132 aa  47.4  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  31.5 
 
 
133 aa  47  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  31.5 
 
 
133 aa  47  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4441  hypothetical protein  36.57 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4257  hypothetical protein  36.57 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0735  hypothetical protein  42.06 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.7492600000000004e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4095  hypothetical protein  36.57 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4106  hypothetical protein  36.57 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4589  hypothetical protein  36.57 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0921  hypothetical protein  40.46 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77995e-43 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4492  hypothetical protein  35.82 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  32.26 
 
 
175 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>