88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3233 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3233  DoxX family protein  100 
 
 		 405 aa  800    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  54.74 
 
 		 378 aa  197  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  48.89 
 
 		 296 aa  153  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13020  hypothetical protein  45.05 
 
 		 279 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.923899  normal  0.136283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4241  DoxX family protein  52.2 
 
 		 297 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1884  DoxX family protein  45.99 
 
 		 277 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0388995  normal  0.30176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1950  DoxX family protein  45.99 
 
 		 277 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.992503  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1904  DoxX  45.99 
 
 		 277 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.920346  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08840  predicted membrane protein  41.56 
 
 		 211 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.258983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6025  DoxX family protein  39.39 
 
 		 283 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1515  DoxX family protein  39.46 
 
 		 177 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1493  DoxX  39.46 
 
 		 177 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1491  DoxX family protein  38.78 
 
 		 177 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  37.04 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4574  DoxX family protein  32.98 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  35.25 
 
 		 172 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1057  DoxX family protein  37.68 
 
 		 176 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3842  DoxX family protein  36.67 
 
 		 128 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000608334  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  38.24 
 
 		 180 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  35.56 
 
 		 144 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5119  DoxX family protein  35.83 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000103447  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  35 
 
 		 185 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  35.25 
 
 		 182 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  36.69 
 
 		 172 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  35.71 
 
 		 185 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5446  hypothetical protein  34.17 
 
 		 128 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5499  hypothetical protein  34.17 
 
 		 128 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000803352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5412  hypothetical protein  34.17 
 
 		 128 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.745190000000001e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5564  hypothetical protein  34.17 
 
 		 128 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5020  hypothetical protein  34.17 
 
 		 128 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5004  hypothetical protein  34.17 
 
 		 128 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.91746e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5170  hypothetical protein  34.17 
 
 		 128 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000171714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  34.53 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  34.27 
 
 		 131 aa  57.4  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  34.53 
 
 		 183 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  34.53 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5443  hypothetical protein  34.17 
 
 		 128 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000785742  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  35.46 
 
 		 134 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5508  hypothetical protein  34.17 
 
 		 128 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000015109  unclonable  3.38736e-26 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  38.06 
 
 		 153 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  32.62 
 
 		 154 aa  53.5  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  38.06 
 
 		 153 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  35.46 
 
 		 147 aa  53.1  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  39.42 
 
 		 173 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  35.38 
 
 		 149 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  32.59 
 
 		 147 aa  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  39.42 
 
 		 173 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  39.42 
 
 		 173 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4065  DoxX  29.9 
 
 		 181 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4140  DoxX family protein  29.9 
 
 		 181 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.977135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5120  DoxX family protein  39.71 
 
 		 205 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1048  DoxX  37.06 
 
 		 178 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.083791  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  35.77 
 
 		 174 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  33.33 
 
 		 131 aa  50.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3737  DoxX family protein  48.78 
 
 		 168 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  36.03 
 
 		 171 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  31.78 
 
 		 138 aa  49.3  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  32.61 
 
 		 127 aa  49.7  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  34.44 
 
 		 145 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4503  DoxX  40.83 
 
 		 197 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4294  DoxX family protein  31.72 
 
 		 181 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  29.37 
 
 		 130 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  32.59 
 
 		 149 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  33.57 
 
 		 148 aa  47.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7013  DoxX family protein  36.67 
 
 		 198 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  31.39 
 
 		 128 aa  47.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  35.25 
 
 		 148 aa  47  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  35.29 
 
 		 144 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  33.08 
 
 		 149 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  32.85 
 
 		 147 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  31.06 
 
 		 133 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  41.67 
 
 		 150 aa  45.8  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  33.83 
 
 		 148 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2130  DoxX family protein  29.58 
 
 		 183 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.354782  normal  0.37108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  36.43 
 
 		 173 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  35.29 
 
 		 145 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2743  DoxX family protein  34.31 
 
 		 177 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000157572  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  33.08 
 
 		 148 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  33.04 
 
 		 134 aa  44.3  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2335  DoxX family protein  37.96 
 
 		 141 aa  44.3  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34190  predicted membrane protein  36.3 
 
 		 167 aa  44.3  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  32.62 
 
 		 154 aa  43.9  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  35.04 
 
 		 144 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  32.85 
 
 		 154 aa  43.9  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  31.65 
 
 		 145 aa  43.5  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  40.91 
 
 		 150 aa  43.5  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  33.08 
 
 		 149 aa  43.1  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  29.77 
 
 		 2449 aa  43.1  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>