96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1904 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_1950  DoxX family protein  100 
 
 
277 aa  547  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.992503  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1904  DoxX  100 
 
 
277 aa  547  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.920346  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1884  DoxX family protein  99.28 
 
 
277 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0388995  normal  0.30176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2120  DoxX family protein  64.77 
 
 
296 aa  330  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4241  DoxX family protein  64.29 
 
 
297 aa  315  4e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13020  hypothetical protein  59.65 
 
 
279 aa  297  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.923899  normal  0.136283 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  41.2 
 
 
378 aa  145  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3233  DoxX family protein  45.99 
 
 
405 aa  138  8.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6025  DoxX family protein  36.16 
 
 
283 aa  96.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08840  predicted membrane protein  45.64 
 
 
211 aa  86.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.258983  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1515  DoxX family protein  35.44 
 
 
177 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1493  DoxX  35.44 
 
 
177 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1491  DoxX family protein  34.81 
 
 
177 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2743  DoxX family protein  33.56 
 
 
177 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000157572  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  35.16 
 
 
144 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  35.94 
 
 
144 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  35.61 
 
 
180 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  33.06 
 
 
149 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  34.4 
 
 
149 aa  63.5  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  30.95 
 
 
149 aa  62  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  30.08 
 
 
151 aa  61.6  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  31.58 
 
 
147 aa  60.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4574  DoxX family protein  33.72 
 
 
198 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4503  DoxX  44.83 
 
 
197 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1048  DoxX  34.09 
 
 
178 aa  59.3  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.083791  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1057  DoxX family protein  38.64 
 
 
176 aa  58.9  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  32.56 
 
 
144 aa  57  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  29.14 
 
 
154 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  34.35 
 
 
171 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  34.97 
 
 
147 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  33.57 
 
 
149 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7013  DoxX family protein  43.33 
 
 
198 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  32.26 
 
 
146 aa  53.1  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  34.35 
 
 
174 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  32.58 
 
 
148 aa  52.4  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4140  DoxX family protein  29.82 
 
 
181 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.977135  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4065  DoxX  29.82 
 
 
181 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4294  DoxX family protein  29.82 
 
 
181 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322086  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  35.88 
 
 
173 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5120  DoxX family protein  35.34 
 
 
205 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  36.09 
 
 
173 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  31.25 
 
 
145 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  25.18 
 
 
154 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  36.09 
 
 
173 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  36.09 
 
 
173 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  32.03 
 
 
144 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  31.01 
 
 
144 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  30.47 
 
 
145 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2335  DoxX family protein  38.06 
 
 
141 aa  50.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  30.47 
 
 
145 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  31.45 
 
 
148 aa  49.3  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  25.16 
 
 
175 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  33.87 
 
 
147 aa  48.9  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  32.26 
 
 
147 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  32.26 
 
 
147 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  33.07 
 
 
149 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  32.26 
 
 
147 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  34.04 
 
 
146 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  32.26 
 
 
147 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  34.92 
 
 
149 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  33.06 
 
 
147 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  29.84 
 
 
148 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  32.86 
 
 
154 aa  47.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  32.37 
 
 
127 aa  47.4  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  36.51 
 
 
150 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0412  DoxX family protein  36.84 
 
 
166 aa  46.2  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  35.71 
 
 
150 aa  45.8  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  34.38 
 
 
148 aa  45.8  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  32.26 
 
 
148 aa  45.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2277  DoxX family protein  37.04 
 
 
146 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  normal  0.928998 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  32.52 
 
 
153 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1775  DoxX family protein  26.87 
 
 
152 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019545 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  32.52 
 
 
153 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3842  DoxX family protein  30.97 
 
 
128 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000608334  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  26.32 
 
 
153 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  32.85 
 
 
147 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  44.94 
 
 
131 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  29.71 
 
 
153 aa  44.3  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5119  DoxX family protein  29.2 
 
 
128 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000103447  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  31.85 
 
 
153 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3171  DoxX family protein  39.13 
 
 
187 aa  43.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  29.55 
 
 
185 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  29.84 
 
 
147 aa  42.7  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  29.84 
 
 
147 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  29.55 
 
 
185 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  30.6 
 
 
136 aa  42.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5170  hypothetical protein  29.2 
 
 
128 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000171714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5004  hypothetical protein  29.2 
 
 
128 aa  42.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.91746e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5020  hypothetical protein  29.2 
 
 
128 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381098  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5446  hypothetical protein  29.2 
 
 
128 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5564  hypothetical protein  29.2 
 
 
128 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  29.84 
 
 
147 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  29.84 
 
 
147 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5412  hypothetical protein  29.2 
 
 
128 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.745190000000001e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5499  hypothetical protein  29.2 
 
 
128 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000803352  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4520  DoxX family protein  33.33 
 
 
146 aa  42  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.590252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>